More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0165 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
268 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  93.66 
 
 
268 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.85 
 
 
268 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.1 
 
 
268 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  77.24 
 
 
268 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  77.61 
 
 
268 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  77.52 
 
 
268 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.34 
 
 
268 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  56.2 
 
 
267 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.96 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.96 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  52.17 
 
 
283 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  52.17 
 
 
283 aa  279  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  52.29 
 
 
305 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  52.55 
 
 
283 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  54.26 
 
 
267 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  55.04 
 
 
267 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.69 
 
 
268 aa  274  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.73 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.49 
 
 
268 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.75 
 
 
268 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  49.43 
 
 
269 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3536  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.08 
 
 
268 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.75 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.75 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  47.71 
 
 
274 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  45.49 
 
 
270 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.67 
 
 
266 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.24 
 
 
274 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.06 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  43.68 
 
 
268 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  44.75 
 
 
273 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.59 
 
 
276 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.31 
 
 
267 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  39.62 
 
 
267 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.56 
 
 
277 aa  208  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.71 
 
 
276 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 
277 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.71 
 
 
276 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.64 
 
 
293 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.71 
 
 
276 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
277 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 
293 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.08 
 
 
276 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.79 
 
 
293 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.92 
 
 
276 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
270 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.98 
 
 
278 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
276 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  42.58 
 
 
276 aa  205  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.06 
 
 
276 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.9 
 
 
276 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  41.06 
 
 
266 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  42.21 
 
 
276 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  42.57 
 
 
258 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.35 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.29 
 
 
293 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.83 
 
 
276 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.37 
 
 
278 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.46 
 
 
277 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.54 
 
 
275 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.62 
 
 
277 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.9 
 
 
274 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  39.85 
 
 
266 aa  201  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.9 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  43.82 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.57 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.37 
 
 
273 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.96 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
276 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.58 
 
 
276 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.46 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.92 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.73 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  42.86 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.02 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.5 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.79 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.51 
 
 
274 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  42.13 
 
 
265 aa  195  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  41.89 
 
 
269 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.7 
 
 
274 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41 
 
 
274 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.58 
 
 
283 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  39.38 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  39.85 
 
 
285 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.02 
 
 
303 aa  188  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1890  Undecaprenyl-diphosphatase  40.58 
 
 
278 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  41.57 
 
 
258 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
269 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  41.09 
 
 
252 aa  182  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  39.73 
 
 
293 aa  182  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.53 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  39.93 
 
 
270 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.26 
 
 
265 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>