40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0137 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  73.12 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  61.29 
 
 		 252 aa  324  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  58.2 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  58.37 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  54.66 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  54.08 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  32.73 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  32.6 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  34.45 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  32.46 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  31.84 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  33.88 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  33.88 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  32.58 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  34.31 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  32.38 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.86 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  29.49 
 
 		 318 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  30.94 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  30.94 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  28.02 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  30.04 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.63 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  28.75 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  27.83 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.88 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  27.16 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  29.29 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  29.36 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  28.02 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  29.21 
 
 		 285 aa  62  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  26.36 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  28.07 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  27.92 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  27.78 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  26.22 
 
 		 300 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  27.39 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  30.17 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  30.41 
 
 		 214 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>