238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0133 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  58.04 
 
 		 934 aa  1045    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  79.87 
 
 		 933 aa  1523    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  63.25 
 
 		 969 aa  1161    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  55.63 
 
 		 968 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 925 aa  1895    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  42.36 
 
 		 930 aa  692    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  42.02 
 
 		 930 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  55.74 
 
 		 968 aa  964    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  57.71 
 
 		 934 aa  1041    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  49.05 
 
 		 936 aa  775    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  80.82 
 
 		 932 aa  1522    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  45.81 
 
 		 912 aa  745    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  41.72 
 
 		 914 aa  689    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  56.53 
 
 		 928 aa  1011    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  80.72 
 
 		 931 aa  1559    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  80.61 
 
 		 933 aa  1534    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  55.45 
 
 		 937 aa  968    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  91.59 
 
 		 931 aa  1739    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  43.91 
 
 		 941 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  55.63 
 
 		 949 aa  979    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  42.78 
 
 		 893 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  47.4 
 
 		 935 aa  755    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  82.33 
 
 		 931 aa  1535    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  57.93 
 
 		 912 aa  1008    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  59.47 
 
 		 936 aa  1015    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  57.41 
 
 		 935 aa  1025    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  41.98 
 
 		 943 aa  714    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  58.34 
 
 		 1029 aa  1004    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  56.48 
 
 		 928 aa  1009    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  41.33 
 
 		 936 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  57.93 
 
 		 934 aa  1043    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  41.92 
 
 		 938 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  54.59 
 
 		 953 aa  923    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  56.97 
 
 		 928 aa  1011    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  55.15 
 
 		 941 aa  926    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  52.94 
 
 		 931 aa  933    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  42.36 
 
 		 930 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  40.92 
 
 		 989 aa  594  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.05 
 
 		 936 aa  534  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.36 
 
 		 924 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  36.42 
 
 		 899 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  32.64 
 
 		 902 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.98 
 
 		 894 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.05 
 
 		 894 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  32.49 
 
 		 899 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 898 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 900 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  33.65 
 
 		 900 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 		 927 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  33.61 
 
 		 900 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.93 
 
 		 893 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  33.49 
 
 		 900 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 900 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  33.92 
 
 		 852 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  34.05 
 
 		 858 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 900 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  33.18 
 
 		 899 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  33.05 
 
 		 900 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  32.89 
 
 		 892 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  34.56 
 
 		 859 aa  412  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  34.56 
 
 		 859 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2766  (protein-PII) uridylyltransferase  46.88 
 
 		 487 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.66342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  33.02 
 
 		 857 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  32.41 
 
 		 899 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  32.89 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  32.75 
 
 		 898 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.44 
 
 		 930 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 		 930 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  32.32 
 
 		 869 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  32.67 
 
 		 900 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  31.12 
 
 		 906 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 858 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.2 
 
 		 930 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  34.08 
 
 		 890 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  33.62 
 
 		 858 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  34.77 
 
 		 890 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  33.46 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  34.77 
 
 		 890 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  34.77 
 
 		 890 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  33.09 
 
 		 858 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.09 
 
 		 864 aa  399  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1759  PII uridylyl-transferase  33.57 
 
 		 875 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.308233 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 		 858 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  33.25 
 
 		 858 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.53 
 
 		 890 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  34.53 
 
 		 890 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  33.42 
 
 		 858 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 		 892 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  34.65 
 
 		 890 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 		 858 aa  396  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.02 
 
 		 894 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  34.65 
 
 		 890 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  34.65 
 
 		 890 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  34.65 
 
 		 890 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.12 
 
 		 900 aa  396  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>