157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0099 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  82.84 
 
 
682 aa  1134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  100 
 
 
676 aa  1379  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  51.4 
 
 
687 aa  664  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  51.58 
 
 
676 aa  676  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  54.79 
 
 
669 aa  684  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2586  protein of unknown function DUF255  51.02 
 
 
691 aa  630  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  48.15 
 
 
680 aa  588  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  46.25 
 
 
676 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  45.48 
 
 
676 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  44.89 
 
 
666 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  44.53 
 
 
666 aa  545  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  43.81 
 
 
666 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  40.03 
 
 
680 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  40.58 
 
 
690 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  41.4 
 
 
681 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  38.76 
 
 
673 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  41.74 
 
 
679 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  42.71 
 
 
681 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  42.18 
 
 
685 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  42.35 
 
 
667 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  39.29 
 
 
675 aa  483  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  39.35 
 
 
752 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  37.85 
 
 
686 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  41.25 
 
 
673 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  41.86 
 
 
696 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  38.18 
 
 
686 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  41.7 
 
 
700 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  39.62 
 
 
700 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  43.09 
 
 
662 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2409  hypothetical protein  47.7 
 
 
743 aa  472  1e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  42.01 
 
 
694 aa  469  1e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  36.3 
 
 
711 aa  467  1e-130  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  41.93 
 
 
676 aa  466  1e-130  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  38.72 
 
 
699 aa  468  1e-130  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  38.63 
 
 
699 aa  465  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.01567e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  38.07 
 
 
671 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  8.09407e-07  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  36.91 
 
 
686 aa  462  1e-128  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  42.82 
 
 
677 aa  462  1e-128  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  38.71 
 
 
681 aa  459  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  41.82 
 
 
682 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  41.69 
 
 
658 aa  448  1e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  41.67 
 
 
680 aa  447  1e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  35.66 
 
 
703 aa  446  1e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  41.82 
 
 
677 aa  448  1e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  38.83 
 
 
684 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  40.59 
 
 
665 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  41.22 
 
 
652 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  38.74 
 
 
670 aa  440  1e-122  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  39.74 
 
 
665 aa  440  1e-122  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  38.12 
 
 
700 aa  439  1e-122  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  39.71 
 
 
672 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  40.98 
 
 
665 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  36.11 
 
 
681 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  39.71 
 
 
718 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  41.46 
 
 
697 aa  439  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  40.03 
 
 
725 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  38.8 
 
 
678 aa  435  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  37.72 
 
 
721 aa  433  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  38.45 
 
 
733 aa  432  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  39.73 
 
 
718 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  38.67 
 
 
746 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  41.19 
 
 
664 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  42.51 
 
 
707 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  39.51 
 
 
722 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  39.04 
 
 
718 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  38 
 
 
714 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  39.3 
 
 
711 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  41.34 
 
 
664 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  39.88 
 
 
669 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  41.34 
 
 
664 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  35.29 
 
 
691 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  39.25 
 
 
693 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  36.59 
 
 
706 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  39.44 
 
 
710 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  33.52 
 
 
687 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  38.01 
 
 
756 aa  417  1e-115  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  37.77 
 
 
750 aa  418  1e-115  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20536e-13 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  43.37 
 
 
673 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  36.8 
 
 
700 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  42.76 
 
 
610 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  40.45 
 
 
673 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.80128e-15  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  36.19 
 
 
723 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  40 
 
 
657 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  39.34 
 
 
696 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  39.02 
 
 
660 aa  406  1e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  38.46 
 
 
699 aa  406  1e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  36.62 
 
 
720 aa  408  1e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  34.42 
 
 
712 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  35.34 
 
 
705 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  38.11 
 
 
715 aa  400  1e-110  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  42.09 
 
 
717 aa  396  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  37.48 
 
 
699 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3705  protein of unknown function DUF255  40.67 
 
 
703 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164339  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  35.57 
 
 
669 aa  398  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  36.83 
 
 
706 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  39.23 
 
 
656 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  44.09 
 
 
667 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  34.28 
 
 
720 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  40.8 
 
 
673 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  45.29 
 
 
682 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>