More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0091 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01874  leucyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
880 aa  808  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
860 aa  741  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
860 aa  716  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
826 aa  702  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5030  leucyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
861 aa  969  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
868 aa  829  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1579  leucyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 
901 aa  1195  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  0.048228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
860 aa  716  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
820 aa  738  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2732  leucyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
864 aa  746  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0200142  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
828 aa  719  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6003  leucyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
911 aa  736  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
874 aa  731  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
872 aa  729  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
814 aa  666  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
824 aa  721  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
860 aa  740  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
868 aa  823  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2983  leucyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
877 aa  768  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.957955  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3380  leucyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
944 aa  773  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07605e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
860 aa  739  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2588  leucyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
864 aa  762  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224639  hitchhiker  2.06331e-09 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0225  leucyl-tRNA synthetase  65.38 
 
 
893 aa  1230  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153759  normal  0.0782283 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1309  leucyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
879 aa  832  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0575  leucyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
864 aa  741  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.932947 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0254  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
890 aa  750  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0479  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
887 aa  724  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1376  leucyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
879 aa  830  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.264613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1404  leucyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 
871 aa  1179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546208  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0621  leucyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
864 aa  743  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
859 aa  726  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  5.16313e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 
861 aa  1198  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0057  leucyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
869 aa  860  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  5.44837e-10 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
865 aa  737  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
868 aa  739  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
874 aa  733  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
873 aa  811  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
815 aa  750  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3198  leucyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 
876 aa  1191  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
823 aa  702  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1830  leucyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
885 aa  723  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  1.80748e-09 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
904 aa  656  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
906 aa  828  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2852  leucyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 
835 aa  941  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.206237  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1740  leucyl-tRNA synthetase  63.85 
 
 
894 aa  1176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.723566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
824 aa  717  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0171  leucyl-tRNA synthetase  83.01 
 
 
874 aa  1541  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2050  leucyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 
864 aa  938  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
824 aa  748  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1095  leucyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 
877 aa  1181  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
838 aa  640  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0632  leucyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
809 aa  642  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
860 aa  739  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
863 aa  723  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.60913e-05 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0074  leucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
821 aa  655  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
860 aa  741  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
860 aa  743  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
862 aa  769  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
904 aa  650  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
820 aa  740  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1446  leucyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 
894 aa  1130  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 
870 aa  1084  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
819 aa  730  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0710  leucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
821 aa  654  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.699276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0473  leucyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
813 aa  643  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
860 aa  716  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
894 aa  748  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
826 aa  721  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
859 aa  724  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0433  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
859 aa  672  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0323197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
857 aa  659  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.49617e-06  hitchhiker  1.03499e-06 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
829 aa  719  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01850  leucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
861 aa  706  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0480687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
852 aa  673  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
856 aa  750  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
824 aa  773  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1187  leucyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
860 aa  699  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0879565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2958  leucyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
860 aa  719  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00600  hypothetical protein  43.69 
 
 
860 aa  741  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1098  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
860 aa  705  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2573  leucyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
877 aa  768  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4250  leucyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 
876 aa  1164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.440973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0422  leucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
876 aa  730  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
828 aa  702  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.02477e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
831 aa  746  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
824 aa  717  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
875 aa  716  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2429  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
820 aa  641  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
853 aa  643  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
875 aa  712  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2132  leucyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
863 aa  774  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.142112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
819 aa  649  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
829 aa  700  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
865 aa  716  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0349  leucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
865 aa  704  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1619  leucyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
815 aa  656  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1582  leucyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
838 aa  647  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
857 aa  766  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.07673e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
818 aa  772  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3144  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
860 aa  720  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>