62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0084 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  81.97 
 
 
339 aa  405  1e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  65.49 
 
 
257 aa  346  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  67.45 
 
 
317 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  68.44 
 
 
315 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  65.7 
 
 
280 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  69.68 
 
 
313 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  53.25 
 
 
312 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.37 
 
 
268 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.35 
 
 
332 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.45 
 
 
314 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.51 
 
 
315 aa  165  7e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.51 
 
 
315 aa  165  7e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.34 
 
 
227 aa  164  1e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.77 
 
 
313 aa  164  1e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.03 
 
 
302 aa  163  2e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.85 
 
 
216 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.51 
 
 
220 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  44.05 
 
 
230 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  44.05 
 
 
258 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  40.88 
 
 
220 aa  140  1e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.12 
 
 
222 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.44 
 
 
230 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.92 
 
 
222 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.65 
 
 
243 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  35.67 
 
 
210 aa  117  2e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.42 
 
 
212 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.59 
 
 
221 aa  109  4e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.57 
 
 
206 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.75 
 
 
212 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.35 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  37.35 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.6 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.54 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.94 
 
 
203 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.84 
 
 
198 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  30.3 
 
 
234 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  2.36321e-07 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.14 
 
 
198 aa  80.1  3e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 
207 aa  76.3  5e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.58 
 
 
206 aa  70.1  3e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.79 
 
 
228 aa  65.5  7e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.71 
 
 
208 aa  61.2  2e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.91 
 
 
217 aa  57.4  3e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.13 
 
 
202 aa  55.8  6e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  34.78 
 
 
171 aa  53.9  2e-06  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.06 
 
 
214 aa  53.5  3e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.12 
 
 
211 aa  53.5  3e-06  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  34.12 
 
 
211 aa  53.5  3e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.59 
 
 
208 aa  53.5  4e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.59 
 
 
208 aa  53.1  4e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.29 
 
 
236 aa  52.8  5e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.5 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  27.19 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.98 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.85 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.25 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  31.25 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.85 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  25.49 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.6 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>