178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0063 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  79.79 
 
 
504 aa  675  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  100 
 
 
480 aa  961  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  66.22 
 
 
469 aa  539  1e-152  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  65.45 
 
 
476 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  63.28 
 
 
474 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  61 
 
 
485 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  60.93 
 
 
476 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  39.6 
 
 
463 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  40.36 
 
 
450 aa  253  5e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  34.26 
 
 
425 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  37.26 
 
 
442 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  34.87 
 
 
419 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  35.19 
 
 
456 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  37.26 
 
 
442 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  32.06 
 
 
422 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  32.74 
 
 
414 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  31.73 
 
 
422 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  35.75 
 
 
419 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  34.74 
 
 
450 aa  149  1e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  31.63 
 
 
415 aa  146  8e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  34.61 
 
 
422 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  33.41 
 
 
422 aa  142  1e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  33.57 
 
 
458 aa  142  1e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  33.57 
 
 
434 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  36.6 
 
 
423 aa  139  8e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  3.26859e-05 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  31.34 
 
 
420 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  30.43 
 
 
413 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  33.09 
 
 
417 aa  132  1e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  33.41 
 
 
457 aa  131  2e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  30.74 
 
 
466 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.12 
 
 
479 aa  129  1e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  29.95 
 
 
409 aa  129  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  31.16 
 
 
424 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  25.33 
 
 
495 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.99 
 
 
495 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  31.75 
 
 
429 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  31.86 
 
 
463 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.82 
 
 
436 aa  120  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  32.52 
 
 
420 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  29.32 
 
 
470 aa  116  8e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.49 
 
 
445 aa  113  7e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.64 
 
 
435 aa  113  1e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  31.11 
 
 
430 aa  112  1e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.62 
 
 
427 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  33.25 
 
 
439 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.87 
 
 
468 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  29.43 
 
 
412 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.95 
 
 
445 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  29.49 
 
 
481 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.95 
 
 
413 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  1.6357e-05  unclonable  4.69192e-08 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  29.65 
 
 
418 aa  86.3  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  27.08 
 
 
438 aa  85.5  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  28.98 
 
 
429 aa  78.6  3e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  24.56 
 
 
628 aa  77.4  6e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  2.82984e-09 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  27.05 
 
 
1199 aa  75.1  2e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.83 
 
 
445 aa  73.2  9e-12  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  24.11 
 
 
433 aa  72.8  1e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  26.25 
 
 
487 aa  72.8  1e-11  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  29.05 
 
 
446 aa  71.2  4e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.06 
 
 
454 aa  68.9  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.35 
 
 
422 aa  67.4  6e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  25.96 
 
 
494 aa  67  7e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  29.82 
 
 
407 aa  66.6  9e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.13 
 
 
459 aa  66.2  1e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  23.81 
 
 
657 aa  65.5  2e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  24.72 
 
 
493 aa  65.1  3e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  29.97 
 
 
411 aa  64.7  3e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  25.36 
 
 
463 aa  64.7  4e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  26.06 
 
 
578 aa  63.9  6e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
494 aa  63.5  9e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  26 
 
 
498 aa  63.2  1e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.46 
 
 
532 aa  62.8  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  26 
 
 
498 aa  63.2  1e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  28.77 
 
 
436 aa  62  2e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  26.33 
 
 
493 aa  62.4  2e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  22.34 
 
 
464 aa  62.4  2e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  41.03 
 
 
492 aa  60.8  5e-08  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  25.32 
 
 
492 aa  60.5  8e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  23.48 
 
 
619 aa  58.9  2e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  23.57 
 
 
619 aa  59.3  2e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  26 
 
 
463 aa  58.2  4e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  24.59 
 
 
490 aa  57.4  6e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.01 
 
 
565 aa  57  7e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  22.89 
 
 
536 aa  56.6  9e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  41.25 
 
 
459 aa  56.2  1e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  43.59 
 
 
494 aa  56.6  1e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  35 
 
 
350 aa  55.8  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  23.04 
 
 
616 aa  55.5  2e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  35.42 
 
 
493 aa  55.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.23 
 
 
624 aa  55.8  2e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  35.42 
 
 
493 aa  55.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  24.14 
 
 
449 aa  55.8  2e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  27.99 
 
 
451 aa  55.5  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.27 
 
 
592 aa  55.1  3e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  26.18 
 
 
999 aa  55.1  3e-06  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  41.98 
 
 
457 aa  55.1  3e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  35.53 
 
 
349 aa  54.7  4e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  26 
 
 
446 aa  54.7  4e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  35.8 
 
 
353 aa  54.3  5e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  39.08 
 
 
463 aa  54.3  5e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>