37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0060 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  100 
 
 
246 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  88.62 
 
 
246 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  78.54 
 
 
251 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  75.2 
 
 
250 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  75.61 
 
 
249 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  75.92 
 
 
248 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  75.51 
 
 
247 aa  354  8e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  46.03 
 
 
241 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  45.63 
 
 
241 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  46.44 
 
 
239 aa  171  8e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  42.19 
 
 
237 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  45.26 
 
 
233 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  43.85 
 
 
238 aa  166  3e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  44.8 
 
 
243 aa  164  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  44.87 
 
 
237 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  44.87 
 
 
237 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  47.98 
 
 
235 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  50.61 
 
 
237 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  42.74 
 
 
242 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  43.7 
 
 
238 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  49.38 
 
 
237 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  37.55 
 
 
239 aa  141  8e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  40.34 
 
 
250 aa  130  2e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  35.17 
 
 
226 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  37.23 
 
 
231 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  42.27 
 
 
240 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  34.85 
 
 
230 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  35.17 
 
 
230 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  41.45 
 
 
231 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  31.25 
 
 
227 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  32.64 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  36.6 
 
 
237 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  30.38 
 
 
236 aa  85.5  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  29.69 
 
 
230 aa  79.7  4e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  32.05 
 
 
249 aa  59.7  4e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  26.32 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  24.73 
 
 
263 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>