More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0054 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
278 aa  547  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  91.37 
 
 
278 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  80.58 
 
 
278 aa  445  1e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  79.35 
 
 
277 aa  446  1e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  80.58 
 
 
278 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  77.7 
 
 
278 aa  440  1e-122  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  78.78 
 
 
278 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  66.79 
 
 
279 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  65.7 
 
 
279 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  66.43 
 
 
279 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  65.34 
 
 
279 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  66.43 
 
 
279 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  67.87 
 
 
277 aa  374  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  65.7 
 
 
279 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  64.49 
 
 
281 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  67.03 
 
 
280 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  66.3 
 
 
279 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  64.62 
 
 
279 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  67.77 
 
 
278 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  66.3 
 
 
280 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  68.13 
 
 
275 aa  364  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  67.28 
 
 
278 aa  361  7e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  67.03 
 
 
279 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  69.45 
 
 
282 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  67.27 
 
 
281 aa  356  2e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  6.73783e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  60.81 
 
 
269 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  65.27 
 
 
267 aa  340  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  59.56 
 
 
270 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  60.44 
 
 
269 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  60.07 
 
 
269 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.24366e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  59.71 
 
 
269 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  59.71 
 
 
269 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  58.61 
 
 
269 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  59.34 
 
 
269 aa  328  5e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  58.46 
 
 
270 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  57.72 
 
 
268 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  63.98 
 
 
263 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  62.98 
 
 
272 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  57.35 
 
 
268 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  65.32 
 
 
263 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  66.53 
 
 
263 aa  313  2e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  66.53 
 
 
263 aa  313  2e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  59.34 
 
 
265 aa  306  4e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  60.64 
 
 
271 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  56.36 
 
 
265 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  53.51 
 
 
275 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  53.26 
 
 
276 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  53.68 
 
 
274 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  53.85 
 
 
266 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  52.26 
 
 
271 aa  238  6e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  45.9 
 
 
267 aa  234  1e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.27 
 
 
267 aa  234  2e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  46.04 
 
 
270 aa  234  2e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  49.58 
 
 
271 aa  232  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  50.85 
 
 
264 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  43.23 
 
 
278 aa  232  6e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  45.93 
 
 
272 aa  231  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  41.97 
 
 
275 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  8.97023e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  51.69 
 
 
277 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  43.54 
 
 
268 aa  225  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  42.02 
 
 
268 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  50.68 
 
 
265 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  42.42 
 
 
267 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  40.6 
 
 
262 aa  221  1e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 
264 aa  220  2e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 
272 aa  220  2e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  46.28 
 
 
271 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  44.8 
 
 
270 aa  219  4e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  47.35 
 
 
268 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  47.35 
 
 
268 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 
267 aa  218  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 
265 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 
265 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  47.95 
 
 
268 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  47.81 
 
 
264 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  47.7 
 
 
265 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 
271 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  44.12 
 
 
271 aa  216  3e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  47.5 
 
 
266 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 
269 aa  215  6e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  41.35 
 
 
265 aa  215  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  45.85 
 
 
271 aa  214  1e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  47.52 
 
 
268 aa  214  1e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  41.61 
 
 
272 aa  213  2e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.28 
 
 
272 aa  213  2e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.94001e-09  hitchhiker  2.8477e-09 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 
265 aa  212  4e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  45.65 
 
 
271 aa  213  4e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
271 aa  212  6e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  45.59 
 
 
269 aa  211  8e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  47.5 
 
 
270 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 
279 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  43.12 
 
 
273 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  46.03 
 
 
270 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  49.54 
 
 
267 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  44.32 
 
 
272 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  44.32 
 
 
272 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 
272 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 
272 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  43.96 
 
 
272 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  45.75 
 
 
273 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>