More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0046 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  74.26 
 
 
505 aa  758  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  72.08 
 
 
506 aa  743  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  73.91 
 
 
506 aa  740  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  66.86 
 
 
509 aa  649  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  84.98 
 
 
507 aa  847  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  72.48 
 
 
505 aa  739  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  50.3 
 
 
523 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  48.5 
 
 
523 aa  455  1e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  51.11 
 
 
529 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  48.16 
 
 
562 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  49.31 
 
 
529 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  47.58 
 
 
540 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  47.78 
 
 
549 aa  418  1e-115  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  48.32 
 
 
514 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  44.89 
 
 
503 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  47.58 
 
 
542 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  44.73 
 
 
513 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  44.53 
 
 
513 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  42.51 
 
 
505 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  43.27 
 
 
504 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  47.17 
 
 
498 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  43.11 
 
 
509 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  39.8 
 
 
497 aa  357  3e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  43.23 
 
 
502 aa  349  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 
362 aa  236  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  38.4 
 
 
472 aa  234  4e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  41.69 
 
 
328 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  39.53 
 
 
323 aa  200  4e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 
363 aa  199  1e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  38.33 
 
 
365 aa  196  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  37.75 
 
 
332 aa  196  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  39.1 
 
 
358 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  38.3 
 
 
360 aa  184  4e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 
342 aa  180  5e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  36.34 
 
 
327 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  38.68 
 
 
341 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  38.51 
 
 
341 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 
328 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 
340 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  34.22 
 
 
332 aa  146  8e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 
323 aa  132  1e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  31.98 
 
 
344 aa  130  4e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  32.5 
 
 
338 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  30.67 
 
 
365 aa  130  7e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  27.82 
 
 
379 aa  129  1e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.6497e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  32.04 
 
 
330 aa  129  2e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  31.65 
 
 
338 aa  128  2e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  30.35 
 
 
329 aa  128  2e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  29.71 
 
 
345 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  34.24 
 
 
308 aa  126  8e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  32.82 
 
 
346 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  32.91 
 
 
350 aa  124  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
346 aa  123  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  31.37 
 
 
333 aa  123  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 
363 aa  123  1e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 
363 aa  122  1e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  32.42 
 
 
338 aa  122  1e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.0357e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  33.87 
 
 
341 aa  122  1e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  51.08 
 
 
150 aa  120  5e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
340 aa  120  8e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 
348 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
349 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  29.71 
 
 
341 aa  119  1e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
349 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 
339 aa  119  1e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
349 aa  119  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 
334 aa  119  2e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
349 aa  118  2e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  28.01 
 
 
312 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  27.98 
 
 
334 aa  117  4e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 
379 aa  117  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  27.86 
 
 
363 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  27.3 
 
 
351 aa  117  7e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 
348 aa  115  1e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 
340 aa  115  1e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  31.35 
 
 
340 aa  115  2e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  30.03 
 
 
379 aa  115  2e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 
361 aa  115  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 
347 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 
342 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 
336 aa  115  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  32.95 
 
 
348 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  33.23 
 
 
342 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 
344 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 
349 aa  114  4e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 
361 aa  114  4e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
345 aa  114  4e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 
349 aa  114  4e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  29.26 
 
 
339 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 
361 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  27.55 
 
 
359 aa  114  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 
362 aa  113  7e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  30.28 
 
 
341 aa  112  1e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
384 aa  112  1e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.33825e-05 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  28.99 
 
 
325 aa  112  1e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  29.77 
 
 
339 aa  112  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  32.06 
 
 
341 aa  113  1e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
363 aa  113  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  31.95 
 
 
363 aa  112  2e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>