More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0042 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  80.84 
 
 
525 aa  835  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  81.23 
 
 
524 aa  835  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
526 aa  1048  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  81.03 
 
 
524 aa  836  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  81.47 
 
 
522 aa  839  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  81.96 
 
 
524 aa  872  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  89.51 
 
 
518 aa  887  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  60.15 
 
 
523 aa  605  1e-172  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  60.47 
 
 
525 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  61.19 
 
 
523 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.85 
 
 
521 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.85 
 
 
520 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.08 
 
 
520 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.96 
 
 
524 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.77 
 
 
517 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.77 
 
 
524 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.61 
 
 
517 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.46 
 
 
520 aa  545  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.76 
 
 
529 aa  533  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.05 
 
 
524 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.99 
 
 
527 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.95 
 
 
527 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.27 
 
 
524 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.56 
 
 
527 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.56 
 
 
527 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.83 
 
 
534 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.66718e-20 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.32 
 
 
511 aa  415  1e-115  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.03 
 
 
509 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.98 
 
 
508 aa  406  1e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.52 
 
 
509 aa  408  1e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.48 
 
 
509 aa  399  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.23 
 
 
493 aa  399  1e-110  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.48 
 
 
509 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  4.09266e-07 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.99 
 
 
512 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.95 
 
 
514 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.48 
 
 
500 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.08 
 
 
519 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.58 
 
 
510 aa  360  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.26 
 
 
519 aa  360  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39.68 
 
 
476 aa  326  6e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.4 
 
 
547 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.81 
 
 
480 aa  317  4e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.14 
 
 
553 aa  314  3e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.88 
 
 
553 aa  313  6e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.55 
 
 
480 aa  311  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.05 
 
 
561 aa  310  3e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  32.71 
 
 
549 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.67 
 
 
506 aa  306  8e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  32.01 
 
 
549 aa  305  1e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.12 
 
 
558 aa  305  1e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.46 
 
 
527 aa  305  2e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.74 
 
 
525 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.37 
 
 
522 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  36.09 
 
 
542 aa  300  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.07 
 
 
522 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33652e-06 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.09 
 
 
525 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.58 
 
 
530 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.34 
 
 
521 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.09 
 
 
525 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.99 
 
 
546 aa  297  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.4 
 
 
514 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.89 
 
 
521 aa  296  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.78 
 
 
525 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.78 
 
 
525 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.78 
 
 
525 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.64 
 
 
525 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.97 
 
 
521 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.37 
 
 
521 aa  294  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.37 
 
 
521 aa  294  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.95 
 
 
517 aa  294  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.41 
 
 
504 aa  294  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.41 
 
 
537 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.79 
 
 
539 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.21 
 
 
525 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.31 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.72 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.72 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.72 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.72 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.72 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.72 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.72 
 
 
525 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0481  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.76 
 
 
560 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0128618  hitchhiker  1.63657e-05 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.58 
 
 
527 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.37 
 
 
509 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0305  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.76 
 
 
560 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.77 
 
 
522 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.56 
 
 
540 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.87 
 
 
517 aa  290  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.32 
 
 
540 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.81 
 
 
546 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.62 
 
 
534 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.72 
 
 
525 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.95 
 
 
525 aa  286  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.02 
 
 
521 aa  285  1e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.87 
 
 
533 aa  284  2e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.87 
 
 
533 aa  283  4e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  36.43 
 
 
529 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.32 
 
 
539 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.02 
 
 
547 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>