More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0038 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0038  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
278 aa  563  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  0.260889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0046  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  95.85 
 
 
266 aa  516  1e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0364  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  79.32 
 
 
266 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0089  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  77.19 
 
 
266 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  75.47 
 
 
266 aa  417  1e-115  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  75.47 
 
 
265 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0074  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  74.34 
 
 
267 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  72.16 
 
 
263 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4128  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  68.56 
 
 
270 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  0.228572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  71.15 
 
 
277 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  69.8 
 
 
263 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  69.53 
 
 
275 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3634  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  68.24 
 
 
262 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  69.53 
 
 
275 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3157  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  69.57 
 
 
261 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  63.95 
 
 
264 aa  348  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.33 
 
 
267 aa  324  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.90233  hitchhiker  8.38501e-11 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  58.23 
 
 
260 aa  308  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  59.84 
 
 
260 aa  306  2e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  59.84 
 
 
260 aa  304  1e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  60 
 
 
253 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.714167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  55.34 
 
 
271 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3396  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  62.04 
 
 
258 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270344  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.55 
 
 
268 aa  283  3e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.03 
 
 
272 aa  277  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.73 
 
 
271 aa  276  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  54.17 
 
 
396 aa  275  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  48.47 
 
 
269 aa  275  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  49.62 
 
 
264 aa  275  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.71 
 
 
278 aa  274  1e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.24 
 
 
270 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.02 
 
 
256 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.43 
 
 
270 aa  271  8e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4411  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.51 
 
 
274 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.31 
 
 
280 aa  270  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.38 
 
 
399 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24873e-07 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.14 
 
 
255 aa  267  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.97 
 
 
266 aa  266  3e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  51.14 
 
 
390 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.89 
 
 
383 aa  265  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1231  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.4 
 
 
262 aa  264  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  50 
 
 
393 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.15 
 
 
270 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.10136e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50 
 
 
392 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.06 
 
 
399 aa  262  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4091  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  56.02 
 
 
274 aa  262  5e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.39 
 
 
287 aa  261  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.3 
 
 
266 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  49.64 
 
 
390 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.14 
 
 
395 aa  260  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.38 
 
 
392 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  50.96 
 
 
393 aa  258  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.82 
 
 
364 aa  257  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  51.31 
 
 
390 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
392 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  51.34 
 
 
393 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  3.25534e-06 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  50.38 
 
 
386 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.94 
 
 
390 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.11 
 
 
269 aa  254  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.4844e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  50.38 
 
 
377 aa  254  1e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.56 
 
 
387 aa  254  1e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
387 aa  254  1e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
395 aa  253  2e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.81 
 
 
393 aa  252  4e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  51.89 
 
 
377 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.14 
 
 
375 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.19 
 
 
390 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.81 
 
 
270 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.33 
 
 
273 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  49.81 
 
 
393 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  47.17 
 
 
388 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.48 
 
 
383 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.48 
 
 
383 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.66 
 
 
266 aa  248  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.18 
 
 
377 aa  248  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.87 
 
 
386 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.36 
 
 
270 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.25 
 
 
386 aa  244  1e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  47.33 
 
 
269 aa  244  1e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.74 
 
 
257 aa  244  2e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.27 
 
 
396 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52 
 
 
407 aa  242  4e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.86 
 
 
403 aa  241  8e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  49.8 
 
 
349 aa  241  8e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  49.25 
 
 
392 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  48.86 
 
 
398 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  47.73 
 
 
390 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.84 
 
 
348 aa  238  6e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  51.38 
 
 
378 aa  238  6e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  47.51 
 
 
389 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0462  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  53.07 
 
 
358 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.987597  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  48.11 
 
 
392 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1907  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.63 
 
 
364 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107566  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.15 
 
 
348 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  48.11 
 
 
400 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  48.11 
 
 
400 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.74 
 
 
390 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  47.52 
 
 
345 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1141  rhodanese-like  42.64 
 
 
381 aa  235  5e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  49.06 
 
 
397 aa  235  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>