More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0035 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  100 
 
 
168 aa  350  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  94.55 
 
 
165 aa  329  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  82.82 
 
 
165 aa  284  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  91.91 
 
 
164 aa  265  3e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  82.76 
 
 
162 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  80.54 
 
 
162 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  85 
 
 
149 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  61.76 
 
 
171 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  57.93 
 
 
166 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  68.29 
 
 
208 aa  187  6e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  60 
 
 
164 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  60 
 
 
164 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  65.35 
 
 
163 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  59.56 
 
 
166 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  59.56 
 
 
166 aa  171  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  56.52 
 
 
139 aa  163  1e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  55.8 
 
 
139 aa  162  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  58.46 
 
 
138 aa  160  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  54.01 
 
 
140 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  54.55 
 
 
147 aa  153  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  54.55 
 
 
147 aa  153  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  54.55 
 
 
145 aa  153  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  54.14 
 
 
143 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.86117e-05 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  54.81 
 
 
158 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  54.62 
 
 
136 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 
137 aa  144  8e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
152 aa  140  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
195 aa  139  2e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  47.18 
 
 
164 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  48.87 
 
 
147 aa  138  4e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  56.59 
 
 
147 aa  138  4e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  51.15 
 
 
142 aa  137  8e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  50.81 
 
 
158 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  50.78 
 
 
138 aa  135  3e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  53.17 
 
 
174 aa  134  7e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  51.49 
 
 
143 aa  133  1e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  49.61 
 
 
146 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  49.61 
 
 
146 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 
146 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  43.75 
 
 
158 aa  125  2e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  45.38 
 
 
164 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  48.67 
 
 
161 aa  108  2e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  39.37 
 
 
131 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  39.37 
 
 
141 aa  92  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  1.29248e-05 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 
136 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  31.54 
 
 
139 aa  75.9  2e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.45 
 
 
146 aa  71.6  4e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  31.25 
 
 
155 aa  70.5  1e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  36.84 
 
 
132 aa  63.9  9e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  32.31 
 
 
134 aa  63.2  2e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  33.88 
 
 
139 aa  62.4  3e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  35.71 
 
 
140 aa  60.1  1e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 
142 aa  60.5  1e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  32.32 
 
 
134 aa  59.7  2e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  30.53 
 
 
134 aa  59.3  3e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 
144 aa  59.3  3e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.39269e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  30.53 
 
 
134 aa  58.9  3e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 
151 aa  58.9  3e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  28.57 
 
 
150 aa  58.5  4e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.86155e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  28.33 
 
 
149 aa  58.5  4e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.20584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
166 aa  58.5  4e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
134 aa  58.5  4e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  29.77 
 
 
135 aa  58.2  5e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.1899e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
139 aa  58.2  5e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
134 aa  57.8  6e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  8.21406e-05 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  32.29 
 
 
150 aa  57.8  7e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.26283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  40.4 
 
 
145 aa  57.8  7e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  35.85 
 
 
139 aa  57  1e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 
134 aa  57.4  1e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
149 aa  57  1e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 
134 aa  57.4  1e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  39.58 
 
 
134 aa  56.6  1e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  2.19354e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  30.88 
 
 
136 aa  56.6  1e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 
135 aa  56.2  2e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  35.35 
 
 
134 aa  56.2  2e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
147 aa  56.6  2e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  31.31 
 
 
136 aa  56.2  2e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 
149 aa  55.5  3e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  39.51 
 
 
158 aa  55.8  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  39.51 
 
 
158 aa  55.8  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
140 aa  55.5  3e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  30.53 
 
 
135 aa  55.8  3e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.5  3e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
134 aa  55.5  4e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  34.44 
 
 
148 aa  55.5  4e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.1  4e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  34.44 
 
 
148 aa  55.5  4e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.1  4e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.68341e-06  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.1  5e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.31479e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.1  5e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.39379e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.1  5e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.88037e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.1  5e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.80206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  33 
 
 
150 aa  55.1  5e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.1  5e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.43772e-09  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
143 aa  55.1  5e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.55764e-09  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  35.56 
 
 
148 aa  54.7  6e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.81175e-07  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  28.57 
 
 
143 aa  54.7  6e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.3166e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
142 aa  54.3  7e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>