More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0024 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  56.49 
 
 
848 aa  919  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  63.38 
 
 
832 aa  786  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  93.69 
 
 
868 aa  1422  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  82.66 
 
 
883 aa  1364  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  54.68 
 
 
907 aa  652  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  86.02 
 
 
880 aa  1421  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  67.32 
 
 
989 aa  904  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 
824 aa  738  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 
875 aa  665  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  83.91 
 
 
886 aa  1337  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  52.11 
 
 
903 aa  636  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.07022e-07  unclonable  3.03018e-08 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  57.99 
 
 
873 aa  785  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  71.15 
 
 
971 aa  944  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  73.36 
 
 
981 aa  961  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  70.38 
 
 
1053 aa  1023  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.68 
 
 
884 aa  688  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  65.24 
 
 
990 aa  907  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 
845 aa  672  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  43.21 
 
 
894 aa  640  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  70.88 
 
 
1083 aa  1052  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  61.97 
 
 
836 aa  771  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  46.81 
 
 
885 aa  639  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 
848 aa  788  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 
921 aa  645  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  61.35 
 
 
838 aa  764  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.73 
 
 
949 aa  638  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.48 
 
 
882 aa  661  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  58.27 
 
 
887 aa  759  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  80.8 
 
 
921 aa  1353  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  61.67 
 
 
990 aa  963  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  58.88 
 
 
861 aa  763  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  54.65 
 
 
856 aa  712  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  58.63 
 
 
1045 aa  767  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  69 
 
 
885 aa  926  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  61.28 
 
 
964 aa  962  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  59.57 
 
 
887 aa  905  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 
949 aa  642  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  62.1 
 
 
856 aa  956  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.72 
 
 
922 aa  650  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  61.14 
 
 
959 aa  961  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.66 
 
 
986 aa  668  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  70.87 
 
 
975 aa  955  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
883 aa  694  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  67.32 
 
 
989 aa  904  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  68 
 
 
886 aa  1109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  68.94 
 
 
917 aa  901  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  56.67 
 
 
907 aa  715  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
871 aa  1739  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  56.66 
 
 
980 aa  664  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  57.58 
 
 
926 aa  957  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  61.82 
 
 
836 aa  770  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  56.61 
 
 
917 aa  933  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  82.9 
 
 
883 aa  1339  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  55.41 
 
 
947 aa  654  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.82401e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.93 
 
 
896 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  43.15 
 
 
891 aa  632  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  46.25 
 
 
902 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  51.5 
 
 
912 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46 
 
 
881 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 
895 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 
896 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 
890 aa  625  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.62 
 
 
898 aa  625  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  52.01 
 
 
853 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  47.55 
 
 
890 aa  625  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 
890 aa  625  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 
890 aa  625  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 
890 aa  625  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 
890 aa  625  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  4.98988e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  51.76 
 
 
894 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  1.80014e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 
890 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345648 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 
890 aa  625  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  47.55 
 
 
890 aa  625  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  54.45 
 
 
971 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 
969 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 
971 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 
975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  49.19 
 
 
985 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 
975 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 
975 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  54.45 
 
 
971 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  51.25 
 
 
882 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 
989 aa  621  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 
975 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 
976 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 
975 aa  622  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 
975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  46.69 
 
 
889 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  9.67139e-05 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 
975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  54.45 
 
 
971 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 
968 aa  621  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  45.27 
 
 
884 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 
880 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.12 
 
 
880 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 
822 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 
920 aa  618  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  50.72 
 
 
1029 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.40569e-05  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 
892 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  54.12 
 
 
972 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 
892 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>