More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0022 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  73.16 
 
 
538 aa  794  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  71.92 
 
 
535 aa  770  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  73.11 
 
 
545 aa  780  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  75.34 
 
 
532 aa  803  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  71.79 
 
 
535 aa  764  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  72.12 
 
 
536 aa  763  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  86.96 
 
 
540 aa  941  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
538 aa  1079  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  76.74 
 
 
531 aa  830  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  65.26 
 
 
572 aa  695  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  72.67 
 
 
545 aa  775  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  73.48 
 
 
544 aa  786  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  87.05 
 
 
537 aa  936  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  87.74 
 
 
539 aa  920  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  73.64 
 
 
560 aa  785  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  87.78 
 
 
541 aa  950  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  95.34 
 
 
536 aa  1030  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  73.86 
 
 
536 aa  790  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  73.32 
 
 
552 aa  782  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  71.65 
 
 
538 aa  755  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  71.76 
 
 
537 aa  769  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  71.76 
 
 
537 aa  769  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  71.4 
 
 
533 aa  760  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  87.69 
 
 
537 aa  961  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  73.11 
 
 
545 aa  779  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  66.1 
 
 
537 aa  724  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  70.91 
 
 
534 aa  754  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  61.95 
 
 
544 aa  634  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  62.67 
 
 
568 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  60.12 
 
 
534 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  59.73 
 
 
535 aa  614  1e-174  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  58.92 
 
 
559 aa  612  1e-174  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  59.73 
 
 
535 aa  614  1e-174  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  59.55 
 
 
538 aa  612  1e-174  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  59.81 
 
 
544 aa  605  1e-172  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  56.14 
 
 
590 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  61.05 
 
 
516 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  60.04 
 
 
548 aa  588  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  64.16 
 
 
506 aa  573  1e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  65.96 
 
 
529 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  64.12 
 
 
523 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  55.04 
 
 
506 aa  507  1e-142  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  41.89 
 
 
517 aa  441  1e-122  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  42.83 
 
 
517 aa  435  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  47.38 
 
 
495 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  45.94 
 
 
493 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  45.94 
 
 
493 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  47.37 
 
 
492 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  44.03 
 
 
491 aa  415  1e-115  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  46.43 
 
 
491 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  46.71 
 
 
490 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.40151e-05  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  45.06 
 
 
495 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  46.23 
 
 
491 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  46.23 
 
 
491 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  43.56 
 
 
493 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  46.23 
 
 
491 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  46.23 
 
 
491 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  46.23 
 
 
491 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  46.23 
 
 
491 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  44.05 
 
 
491 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  43.85 
 
 
491 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  44.14 
 
 
491 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  46.23 
 
 
491 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  43.45 
 
 
491 aa  406  1e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  43.76 
 
 
493 aa  407  1e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  46.41 
 
 
498 aa  408  1e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  46.03 
 
 
491 aa  405  1e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  46.85 
 
 
491 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  43.65 
 
 
499 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  45.24 
 
 
491 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  45.24 
 
 
491 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1730  transcription elongation factor NusA  45.83 
 
 
491 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  45.24 
 
 
491 aa  401  1e-110  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  45.24 
 
 
491 aa  401  1e-110  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  45.24 
 
 
491 aa  401  1e-110  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  45.44 
 
 
491 aa  399  1e-110  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2425  NusA antitermination factor  43.02 
 
 
506 aa  400  1e-110  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  5.62867e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  45.24 
 
 
491 aa  401  1e-110  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03397  transcription elongation factor NusA  45.08 
 
 
495 aa  400  1e-110  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3384  NusA antitermination factor  44.05 
 
 
494 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0163394  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  42.59 
 
 
493 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  45.63 
 
 
491 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  44.47 
 
 
506 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  45.83 
 
 
491 aa  398  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3597  transcription elongation factor NusA  44.42 
 
 
495 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.79276e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3992  transcription elongation factor NusA  44.42 
 
 
495 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.90041e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  42.59 
 
 
493 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  46.31 
 
 
501 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3731  transcription elongation factor NusA  44.42 
 
 
495 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00415908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002608  transcription termination protein NusA  44.47 
 
 
495 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000346209  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  43.65 
 
 
494 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2562  NusA antitermination factor  43.65 
 
 
494 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0312455  hitchhiker  0.00289599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  45.38 
 
 
501 aa  395  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  45.34 
 
 
503 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  45.34 
 
 
503 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2750  NusA antitermination factor  42.77 
 
 
494 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504995  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3466  transcription elongation factor NusA  44.42 
 
 
496 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  43.06 
 
 
492 aa  392  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  44.07 
 
 
493 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  43.25 
 
 
506 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>