More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0018 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
535 aa  1062  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  72.08 
 
 
536 aa  754  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  72.83 
 
 
536 aa  758  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  70.53 
 
 
536 aa  729  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  73.45 
 
 
534 aa  773  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  74.04 
 
 
536 aa  775  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  87.92 
 
 
541 aa  931  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  50.51 
 
 
540 aa  440  1e-122  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  47.88 
 
 
556 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  44.38 
 
 
557 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  47.68 
 
 
567 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  48.15 
 
 
567 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  49.61 
 
 
553 aa  407  1e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  43.2 
 
 
532 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  43.45 
 
 
532 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  43.02 
 
 
532 aa  400  1e-110  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  45.45 
 
 
543 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  44.02 
 
 
550 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  44.91 
 
 
576 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  48.24 
 
 
566 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  44.11 
 
 
528 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  43.78 
 
 
534 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  44.4 
 
 
534 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  42.69 
 
 
543 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  4.81156e-12 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  39.79 
 
 
541 aa  353  5e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  40.71 
 
 
523 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  40.71 
 
 
523 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  37 
 
 
537 aa  284  3e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  38.22 
 
 
531 aa  275  1e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  36.71 
 
 
502 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  32.82 
 
 
501 aa  261  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  31.69 
 
 
488 aa  245  2e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  37.72 
 
 
508 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.17 
 
 
528 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.45 
 
 
495 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  35.92 
 
 
487 aa  239  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  37.89 
 
 
495 aa  235  1e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  34.57 
 
 
525 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  36.77 
 
 
495 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  35.05 
 
 
472 aa  224  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  34.72 
 
 
497 aa  223  5e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  32.89 
 
 
522 aa  202  1e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 
506 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  31.06 
 
 
573 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.68 
 
 
507 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  33.65 
 
 
509 aa  193  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.63 
 
 
507 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  32.23 
 
 
521 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.62 
 
 
479 aa  186  1e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  32.3 
 
 
542 aa  185  2e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.12 
 
 
537 aa  183  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  32.4 
 
 
502 aa  183  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  32.09 
 
 
513 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  30.5 
 
 
588 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.3 
 
 
512 aa  180  6e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
510 aa  180  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  32.21 
 
 
511 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.33 
 
 
523 aa  179  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  32.95 
 
 
515 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  32.95 
 
 
515 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  29.24 
 
 
524 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  32.95 
 
 
515 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.81 
 
 
525 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.39 
 
 
509 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.17 
 
 
514 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 
510 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  32.64 
 
 
477 aa  176  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  30.85 
 
 
516 aa  176  1e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
529 aa  175  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  30.38 
 
 
504 aa  175  2e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
529 aa  174  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
529 aa  174  4e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
529 aa  174  4e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.39 
 
 
529 aa  173  6e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  31.65 
 
 
509 aa  173  6e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
503 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
521 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.64 
 
 
524 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  28.81 
 
 
521 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.25 
 
 
503 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  26.59 
 
 
522 aa  171  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  30.68 
 
 
516 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.64 
 
 
509 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
518 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
518 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  32.46 
 
 
523 aa  169  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
510 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  31.16 
 
 
512 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 
529 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
512 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  30.47 
 
 
512 aa  167  6e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  30.58 
 
 
515 aa  166  7e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  2.54581e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 
532 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  8.38838e-07  hitchhiker  2.62387e-05 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  26.76 
 
 
524 aa  166  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  30.6 
 
 
506 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.45 
 
 
509 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  29.32 
 
 
505 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  30.28 
 
 
512 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  30.28 
 
 
512 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  30.76 
 
 
516 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>