More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0013 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  100 
 
 
156 aa  319  9e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  91.84 
 
 
149 aa  277  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0044  ferric uptake regulator family protein  86.39 
 
 
150 aa  266  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  85.03 
 
 
151 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0244  ferric-uptake regulator  89.78 
 
 
143 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0588  ferric uptake regulator family protein  81.17 
 
 
165 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  86.13 
 
 
143 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  70.37 
 
 
140 aa  205  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  69.63 
 
 
144 aa  197  4e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  63.58 
 
 
168 aa  194  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  70.9 
 
 
142 aa  194  5e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  70.15 
 
 
142 aa  193  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  66.92 
 
 
139 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  67.42 
 
 
135 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  70.77 
 
 
135 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  65.65 
 
 
140 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  66.41 
 
 
137 aa  177  6e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  59.12 
 
 
140 aa  176  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  59.54 
 
 
141 aa  170  8e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  61.83 
 
 
137 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  63.36 
 
 
137 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  61.07 
 
 
137 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  61.07 
 
 
137 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  60.31 
 
 
138 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  53.97 
 
 
151 aa  145  1e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2101  ferric uptake regulator, Fur family  56.91 
 
 
158 aa  144  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  55.83 
 
 
142 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1654  ferric uptake regulation protein, putative  51.47 
 
 
141 aa  144  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.179894  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1243  ferric uptake regulator family protein  51.47 
 
 
141 aa  143  7e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4436  ferric uptake regulator family protein  48.48 
 
 
144 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1601  putative ferric uptake regulation protein  50.74 
 
 
141 aa  140  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  47.69 
 
 
138 aa  134  7e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  51.11 
 
 
142 aa  133  1e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  50.78 
 
 
150 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  42.5 
 
 
148 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  42.5 
 
 
148 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1260  ferric uptake regulator family protein  45.83 
 
 
140 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  45 
 
 
150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  45 
 
 
150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  45 
 
 
150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.69196e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  45 
 
 
150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  6.79753e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.38653e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.77584e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.82448e-07  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.60215e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  42.5 
 
 
148 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.35806e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  45 
 
 
150 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.69107e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  45 
 
 
148 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  40.94 
 
 
143 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.66153e-09  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  40.16 
 
 
143 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.22874e-08  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  41.8 
 
 
136 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  40.16 
 
 
147 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  39.37 
 
 
143 aa  100  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
161 aa  100  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.1646e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  39.37 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.86155e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 
150 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  42.5 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.81175e-07  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  38.1 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.43772e-09  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  38.1 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.39379e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  44.35 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  38.1 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.31479e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  39.67 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  38.1 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.55764e-09  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  44.54 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.80206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.88037e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  40.83 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  39.17 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  37.4 
 
 
135 aa  97.1  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.1899e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  41.67 
 
 
149 aa  97.1  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  40.98 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.99535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  96.3  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  40.83 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.68341e-06  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  38.4 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  40.83 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.20584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  38.33 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  40 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.06726e-07  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  39.85 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  43.55 
 
 
144 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  39.67 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1459  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.773495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  40.5 
 
 
135 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1516  FUR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.995871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  42.15 
 
 
176 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  39.68 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  42.62 
 
 
143 aa  94.4  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  41.3 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  41.3 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  41.3 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  38.84 
 
 
134 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  40.34 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>