280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0009 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  87.36 
 
 
191 aa  323  8e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  76.32 
 
 
189 aa  306  1e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  74.21 
 
 
188 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  73.33 
 
 
188 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  73.33 
 
 
188 aa  272  2e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  76.67 
 
 
188 aa  273  2e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  68.59 
 
 
190 aa  270  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  68.06 
 
 
189 aa  263  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  66.84 
 
 
186 aa  261  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  66.49 
 
 
187 aa  258  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  64.71 
 
 
188 aa  256  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  64.17 
 
 
188 aa  254  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  67.02 
 
 
190 aa  253  1e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  67.02 
 
 
190 aa  253  1e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  64.92 
 
 
188 aa  253  1e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  1.81724e-05 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  63.35 
 
 
188 aa  253  2e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  63.35 
 
 
188 aa  252  2e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  63.35 
 
 
188 aa  253  2e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  63.68 
 
 
186 aa  250  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  61.38 
 
 
192 aa  248  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  61.58 
 
 
187 aa  246  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  58.95 
 
 
187 aa  246  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  61.05 
 
 
187 aa  242  2e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  62.11 
 
 
184 aa  243  2e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  61.05 
 
 
187 aa  239  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  60.73 
 
 
201 aa  239  3e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  63.35 
 
 
187 aa  237  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  62.83 
 
 
188 aa  234  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  58.95 
 
 
186 aa  233  1e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  61.05 
 
 
186 aa  227  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  63.68 
 
 
187 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  59.47 
 
 
186 aa  224  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  60.53 
 
 
185 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.5 
 
 
190 aa  218  4e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  56.91 
 
 
192 aa  218  4e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  53.16 
 
 
183 aa  214  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  56.32 
 
 
195 aa  209  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  54.21 
 
 
189 aa  207  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  53.65 
 
 
187 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  51.89 
 
 
191 aa  195  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  51.56 
 
 
187 aa  193  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  46.77 
 
 
206 aa  183  2e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  44.74 
 
 
180 aa  180  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  47.42 
 
 
254 aa  179  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  44.78 
 
 
326 aa  179  3e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  48.44 
 
 
309 aa  177  6e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  43.98 
 
 
186 aa  171  8e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  46.84 
 
 
186 aa  167  7e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  43.24 
 
 
191 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  42.64 
 
 
195 aa  148  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 
183 aa  146  2e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  39.47 
 
 
242 aa  142  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.17 
 
 
198 aa  138  5e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  39.78 
 
 
299 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.41 
 
 
198 aa  117  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.37 
 
 
200 aa  115  4e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  31.28 
 
 
305 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.84 
 
 
299 aa  96.7  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  31.15 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.65 
 
 
202 aa  79.3  3e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  26.52 
 
 
186 aa  75.5  4e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
72 aa  70.9  1e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.13557e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
74 aa  68.2  7e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  47.83 
 
 
80 aa  64.7  7e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 
80 aa  63.9  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 
74 aa  64.3  1e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.4465e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 
80 aa  63.9  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.88 
 
 
73 aa  63.9  1e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.26 
 
 
79 aa  62.8  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  46.77 
 
 
78 aa  62.8  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.26 
 
 
79 aa  62.8  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.3 
 
 
80 aa  62  5e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.88 
 
 
73 aa  62  5e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  43.24 
 
 
81 aa  61.6  7e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  45.16 
 
 
78 aa  61.2  8e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  40.54 
 
 
81 aa  60.8  1e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  40.54 
 
 
81 aa  60.8  1e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.44 
 
 
283 aa  60.8  1e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  42.86 
 
 
76 aa  61.2  1e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.9 
 
 
77 aa  60.8  1e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  1.33842e-14 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 
81 aa  60.5  1e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  40.54 
 
 
81 aa  60.8  1e-08  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  47.46 
 
 
73 aa  59.7  2e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.95477e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  42.62 
 
 
76 aa  59.7  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  48.33 
 
 
74 aa  59.7  2e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.01792e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 
72 aa  60.5  2e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.10342e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  41.76 
 
 
213 aa  59.3  3e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  48.33 
 
 
103 aa  59.7  3e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 
76 aa  59.3  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  40.26 
 
 
81 aa  59.7  3e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>