32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0008 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  324  4e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  90.24 
 
 
164 aa  303  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  73.78 
 
 
164 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  69.51 
 
 
164 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  67.07 
 
 
164 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  69.51 
 
 
164 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  59.15 
 
 
164 aa  199  2e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  51.55 
 
 
168 aa  164  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  45.73 
 
 
163 aa  154  5e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  46.95 
 
 
162 aa  144  4e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  45.73 
 
 
163 aa  143  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  1.51739e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  47.53 
 
 
167 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  47.56 
 
 
163 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  45.06 
 
 
167 aa  131  4e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  46.34 
 
 
163 aa  131  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  45.7 
 
 
168 aa  130  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  45.73 
 
 
163 aa  128  4e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  46.95 
 
 
179 aa  126  1e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  44.51 
 
 
162 aa  125  2e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  42.67 
 
 
151 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
151 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  42.11 
 
 
158 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  42 
 
 
151 aa  112  2e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  36.48 
 
 
173 aa  112  2e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  40.67 
 
 
151 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  37.59 
 
 
134 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  37.66 
 
 
185 aa  97.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  33.56 
 
 
152 aa  68.6  3e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
151 aa  60.8  7e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  37.75 
 
 
151 aa  54.3  8e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>