220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0071 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0035  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000581838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0058  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0016  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  91.94 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  93.1 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0031  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0020  tRNA-Arg  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0817304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  89.06 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000427256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0055  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0773774  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0009  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000152408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0033  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0015  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0299622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  94.44 
 
 		 1137 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0053  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0009  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1397  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00007  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0067  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0051  tRNA-Arg  84.85 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0582  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0017  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0241  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.628692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0638  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.737204  normal  0.415915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0081  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5013  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4647  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.695666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>