121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0053 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000194568  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309295  tRNA-Pro  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0017  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0061005  normal  0.238616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0018  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.452658 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0012  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0290089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0047  tRNA-Pro  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0054  tRNA-Pro  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0077  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14020  tRNA-Pro  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0019  tRNA-Pro  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100673  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0005  tRNA-Pro  86.36 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0034  tRNA-Pro  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.870471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0012  tRNA-Pro  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0029  tRNA-Pro  85.9 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.981305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0040  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0032  tRNA-Pro  96.88 
 
 
78 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0580782  normal  0.580774 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.281731  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0044  tRNA-Pro  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0031  tRNA-Pro  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0616283  decreased coverage  0.00565268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0033  tRNA-Pro  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.216286  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0032  tRNA-Pro  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  94.12 
 
 
77 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0010  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0035  tRNA-Pro  87.72 
 
 
78 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  85.25 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0031  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0027  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00837628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0534  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0026  tRNA-Pro  83.82 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0021  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0044  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0018  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121924  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0093  tRNA-Pro  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0024  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253292  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0032  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0018  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0037  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0034  tRNA-Pro  90 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.191079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0053  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379391  normal  0.108356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0032  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601376  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0026  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0027  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0062  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0042  tRNA-Pro  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0022  tRNA-Pro  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0044  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151219  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0025  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0044  tRNA-Pro  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.180839  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>