More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0027 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_5670  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2910 bp  1067  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5689  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5686  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.955939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5683  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5676  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5648  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5643  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0112274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5631  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5626  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5619  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0029  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 
3009 bp  718  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0003  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 
3009 bp  718  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.168115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5037  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.90364e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0850  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.23811e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0596  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.24077e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0357  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00725974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  88.42 
 
 
2909 bp  1059  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5692  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5695  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.126325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5704  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5668  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5309  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.596088  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5285  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5229  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184478  hitchhiker  3.03284e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5150  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00141737  normal  0.070954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5039  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0878914  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5017  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5011  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.722253  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5005  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4995  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4989  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.748751  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4779  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.42795e-06  hitchhiker  4.00122e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4580  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.75737e-06  normal  0.14639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0210  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.47576e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5821  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0109285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5723  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00121297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0342  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0924378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0331  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0325  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0212799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0049  23S ribosomal RNA segment  87.27 
 
 
3298 bp  1005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0030  23S ribosomal RNA segment  87.27 
 
 
3298 bp  1005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00296414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0008  23S ribosomal RNA segment  87.27 
 
 
3298 bp  1005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  88.71 
 
 
2908 bp  1082  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0054  23S ribosomal RNA segment  87.27 
 
 
3298 bp  1005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.26274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  87.94 
 
 
3357 bp  1195  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  87.94 
 
 
3357 bp  1195  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0303  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0185  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.05814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0105  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.7794e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0092  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0130944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0034  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0071  23S ribosomal RNA  84.25 
 
 
2850 bp  728  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.764689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0036  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 
2850 bp  735  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0031  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 
2850 bp  735  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0021  23S ribosomal RNA  84.35 
 
 
2850 bp  735  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.335485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0024  23S ribosomal RNA  86.04 
 
 
2847 bp  870  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00320172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0008  23S ribosomal RNA  86.04 
 
 
2847 bp  870  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  99.94 
 
 
3129 bp  6187  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3129 bp  6203  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3129 bp  6203  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3129 bp  6203  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 
2908 bp  1074  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0062  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 
2972 bp  700  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0045  23S ribosomal RNA  87.3 
 
 
2976 bp  1118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.570059  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0042  23S ribosomal RNA  87.3 
 
 
2936 bp  1126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  6.50821e-10 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0036  23S ribosomal RNA  87.04 
 
 
2934 bp  1094  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0010  23S ribosomal RNA  87.21 
 
 
2934 bp  1110  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  92.69 
 
 
2943 bp  787  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  92.69 
 
 
2946 bp  787  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  92.69 
 
 
2946 bp  787  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  92.69 
 
 
2946 bp  787  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  92.69 
 
 
2944 bp  787  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  92.69 
 
 
2944 bp  787  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0007  23S ribosomal RNA  84.47 
 
 
3044 bp  674  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08390  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 
2947 bp  680  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0043  23S ribosomal RNA  85.46 
 
 
2993 bp  775  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0022  23S ribosomal RNA  85.46 
 
 
2993 bp  775  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.851566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0070  23S ribosomal RNA  84.25 
 
 
2954 bp  728  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0060  23S ribosomal RNA  84.25 
 
 
2954 bp  728  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0050  23S ribosomal RNA  87.21 
 
 
2935 bp  1118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0059  23S ribosomal RNA  87.3 
 
 
2935 bp  1126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0882856  normal  0.887302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0063  23S ribosomal RNA  87.04 
 
 
2976 bp  1094  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0059  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 
2972 bp  700  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0139247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0032  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 
2972 bp  700  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.922889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0009  23S ribosomal RNA  83.54 
 
 
2961 bp  698  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.609775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  87.87 
 
 
2927 bp  1209  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  87.78 
 
 
2927 bp  1201  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>