More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0027 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  85.74 
 
 
2958 bp  831    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  85.74 
 
 
2958 bp  831    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2909 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2926 bp  1067    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  88.42 
 
 
2911 bp  1059    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2851 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  88.42 
 
 
2911 bp  1059    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-9  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2912 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2912 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2912 bp  1067    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr02  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 
2736 bp  690    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr05  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 
2736 bp  690    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 
2913 bp  1053    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2911 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2912 bp  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 
2956 bp  787    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 
2956 bp  787    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  85.64 
 
 
2983 bp  823    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  85.64 
 
 
2983 bp  823    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0004  23S ribosomal RNA  83.62 
 
 
2817 bp  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0023  23S ribosomal RNA  83.62 
 
 
2816 bp  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0053  23S ribosomal RNA  83.62 
 
 
2814 bp  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.652954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0076  23S ribosomal RNA  83.62 
 
 
2798 bp  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  88.42 
 
 
2908 bp  1059    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SI  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  88.42 
 
 
2908 bp  1059    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  88.51 
 
 
2908 bp  1067    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  88.08 
 
 
2972 bp  1243    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  84.7 
 
 
3000 bp  799    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  86.56 
 
 
2909 bp  924    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2907 bp  932    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  86.56 
 
 
2908 bp  924    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  86.56 
 
 
2908 bp  924    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  86.76 
 
 
2908 bp  928    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  86.56 
 
 
2908 bp  924    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2908 bp  932    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  86.75 
 
 
2907 bp  940    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 
2907 bp  932    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
3529 bp  1074    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
3088 bp  1074    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
3260 bp  1074    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0450  23S ribosomal RNA  90.18 
 
 
2632 bp  674    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.226128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1798  23S ribosomal RNA  90.36 
 
 
2631 bp  682    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  9.25169e-21 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1804  23S ribosomal RNA  90.36 
 
 
2631 bp  682    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000784168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0016  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 
2811 bp  850    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629398  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0048  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 
2811 bp  850    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>