More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0022 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.59989e-13  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  97.33 
 
 
77 bp  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  6.12862e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.20832e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.30751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.50428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.36537e-05  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.3753e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.22634e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0117  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.214909  hitchhiker  3.6975e-06 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0125  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.66673e-06  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0145  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.66193e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.36234e-08  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  2.38456e-09  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65135e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  3.39625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.36234e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.57655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  95.83 
 
 
74 bp  119  1e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13960  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.65438e-06  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna065  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.22671e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna063  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.57869e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0019  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.79492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.17979e-29 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna067  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.91703e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.12746e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  9.1391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0109  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000630943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>