More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2949 on replicon NC_010715
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  41.71 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  36.18 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  38.5 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  37.09 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  35.92 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  38.34 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5624  resolvase domain-containing protein  33.5 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  31.55 
 
 		 198 aa  98.2  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  35.75 
 
 		 318 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  35.23 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  31.96 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  33.68 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  34.02 
 
 		 186 aa  89  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  35.05 
 
 		 183 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  35.05 
 
 		 183 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  34.54 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  31 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  32.64 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  32.47 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  30.77 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  33.16 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  35.57 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  35.57 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  28.64 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  32.64 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  34.02 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  30.21 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  34.38 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  32.63 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  32.32 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  31.09 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  32.32 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  29.47 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  32.99 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  32.99 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  30.65 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  32.99 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  30.3 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  31.41 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  31.41 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  30.66 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  28.72 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  33.33 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2322  DNA recombinase  39.13 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  31.25 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  32.47 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  29.8 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  32.99 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  29.35 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  30.89 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  30.37 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  26.9 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  27.67 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  32.65 
 
 		 309 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  31.25 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  28.65 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  28.57 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  28.57 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  28.57 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  29.79 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  30.26 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  29.8 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  29.69 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  25.25 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  30.96 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  30.26 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  32.63 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  29.59 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  30.85 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  28 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  29.59 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  27.78 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  29.59 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.66 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>