More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2935 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0856  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 47 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13959  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 47 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4700  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 45 aa  57.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2997  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000491058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2674  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000637872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3730  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.458139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5415  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 48 aa  55.8  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9389  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 45 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0319883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 54 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 53 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3379  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 53 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4548  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0003403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7100  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 47 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5096  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4498  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4361  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 53 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 45 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  61.36 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  63.64 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0642  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  53.9  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0779335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 52 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5789  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885674  normal  0.0150043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5413  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  66.67 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0008  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0331867  normal  0.0953733 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 53 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4513  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334556 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 53 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 51 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4172  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000696082  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>