62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2866 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  100 
 
 
451 aa  904    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  45.86 
 
 
392 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  42.78 
 
 
393 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  38.58 
 
 
393 aa  250  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  40 
 
 
373 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  36.81 
 
 
382 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  35.88 
 
 
385 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  34.45 
 
 
396 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  32.39 
 
 
434 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  34.03 
 
 
404 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  37.92 
 
 
409 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  32.81 
 
 
370 aa  176  9e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  31.66 
 
 
381 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  42.48 
 
 
416 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  33.03 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  29.28 
 
 
396 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  29.62 
 
 
395 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  31.93 
 
 
397 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  30.67 
 
 
436 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  30.62 
 
 
599 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  32.85 
 
 
513 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  31.35 
 
 
446 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  33.08 
 
 
345 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  28.66 
 
 
563 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  33.19 
 
 
428 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  31.48 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  32.03 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  35.45 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  31.74 
 
 
484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  30.79 
 
 
447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  37.75 
 
 
448 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  30.8 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  36.27 
 
 
449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  30.88 
 
 
427 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  36.18 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  27.49 
 
 
370 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  27.49 
 
 
370 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  27.08 
 
 
438 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  26.67 
 
 
370 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  31.78 
 
 
404 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  28.53 
 
 
424 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  28.53 
 
 
424 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  32.19 
 
 
480 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  28.8 
 
 
410 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  27.42 
 
 
413 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  27.95 
 
 
261 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  27.33 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  28.28 
 
 
260 aa  93.6  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  28.28 
 
 
260 aa  93.6  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  34.47 
 
 
416 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  28.12 
 
 
376 aa  87  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  28.47 
 
 
386 aa  86.7  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  25 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  28.57 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  22.15 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  27.64 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  26.56 
 
 
258 aa  63.9  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  21.88 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  26.52 
 
 
257 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  23.04 
 
 
372 aa  53.5  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0867  hypothetical protein  25.52 
 
 
253 aa  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  29.32 
 
 
258 aa  46.6  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>