More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2858 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 412 aa  855    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  66.18 
 
 		 412 aa  584  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 		 411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 		 413 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 412 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 412 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  65.78 
 
 		 414 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  67 
 
 		 420 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  65.77 
 
 		 415 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 413 aa  567  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 410 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  64.62 
 
 		 418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  65.04 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 415 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  66.09 
 
 		 413 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 		 423 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 413 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 413 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 413 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 414 aa  551  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 414 aa  552  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 423 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 416 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 423 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 412 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 414 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  62.99 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  61.06 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 416 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 411 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  62.9 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 508 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  60.74 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 414 aa  521  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>