More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2812 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
427 aa  839    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 
438 aa  326  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
392 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
408 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
402 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  25.87 
 
 
415 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  25 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  23.91 
 
 
404 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  24.52 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  23.43 
 
 
404 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  23.67 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  23.43 
 
 
404 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  23.43 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  25 
 
 
407 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  25.87 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  24.3 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  22.81 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.19 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  22.98 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  22.03 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  22.98 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  23.74 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.74 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  23.74 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  25.08 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  23.48 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  22.79 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  23.34 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  22.65 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  26.22 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  22.02 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  26.22 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19400  arabinose efflux permease family protein  25.63 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  22.43 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
458 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  22.43 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  21.88 
 
 
455 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.53 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  22.17 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  22.43 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  22.75 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  25.61 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  21.9 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  21.86 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 
439 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  26.67 
 
 
453 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.76 
 
 
461 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  26.03 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.47 
 
 
428 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  25.51 
 
 
411 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 
439 aa  63.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  26.25 
 
 
441 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  26.53 
 
 
468 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
460 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  22.52 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  22.52 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  23.3 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  23.3 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  22.33 
 
 
425 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  22.52 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  22.05 
 
 
432 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 
436 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  22.22 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.74 
 
 
460 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
497 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  23.3 
 
 
453 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
433 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  21.57 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
434 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.81 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  20.91 
 
 
429 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 
427 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  22.51 
 
 
408 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  21.29 
 
 
429 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  23.64 
 
 
460 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  22.25 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.39 
 
 
483 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  23.81 
 
 
445 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  23.81 
 
 
445 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  21.65 
 
 
446 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>