More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2790 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
527 aa  1078    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  33.69 
 
 
505 aa  273  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 
532 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 
520 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  31.83 
 
 
497 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  30.18 
 
 
518 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  31.78 
 
 
460 aa  216  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
495 aa  216  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 
534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
526 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 
516 aa  211  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
528 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
499 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  30.51 
 
 
595 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.63 
 
 
509 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.94 
 
 
542 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
535 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.13 
 
 
535 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
495 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
509 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 
517 aa  200  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
526 aa  199  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.46 
 
 
518 aa  199  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 
527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 
526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
544 aa  199  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.83 
 
 
520 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
524 aa  197  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 
514 aa  196  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
506 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
512 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
535 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 
516 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 
531 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 
514 aa  194  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.49 
 
 
506 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
526 aa  190  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  29.85 
 
 
513 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
530 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 
533 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4134  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 
516 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 
537 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
509 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
527 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 
546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.33 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.69 
 
 
521 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.48 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.48 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.48 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.53 
 
 
525 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  27.71 
 
 
517 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  27.52 
 
 
519 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
548 aa  182  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
528 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 
528 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
529 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.4 
 
 
528 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 
524 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
556 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
538 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
526 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.05 
 
 
538 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.19 
 
 
530 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 
528 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.44 
 
 
532 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
520 aa  178  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
528 aa  177  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.68 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  26.52 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  30.45 
 
 
524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.3 
 
 
512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  26.52 
 
 
512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.3 
 
 
512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.3 
 
 
512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
539 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.3 
 
 
512 aa  174  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
512 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.09 
 
 
512 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.09 
 
 
512 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
524 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.54 
 
 
532 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.09 
 
 
512 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.09 
 
 
512 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.09 
 
 
493 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.31 
 
 
528 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 
522 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.09 
 
 
512 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
540 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>