More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2616 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  100 
 
 
367 aa  723    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  49.05 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  51.66 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  44.19 
 
 
355 aa  294  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  43.44 
 
 
375 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  45.25 
 
 
361 aa  285  8e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  49.66 
 
 
350 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  41.64 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.19 
 
 
373 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  42.77 
 
 
374 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  40 
 
 
357 aa  265  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  39.89 
 
 
354 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  43.1 
 
 
360 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  40.88 
 
 
369 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  47.96 
 
 
355 aa  257  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  42.54 
 
 
340 aa  252  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  45.49 
 
 
301 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 
356 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.78 
 
 
361 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  45.97 
 
 
349 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  42.77 
 
 
359 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  42.47 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  39.39 
 
 
348 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  39.54 
 
 
344 aa  242  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  39.07 
 
 
357 aa  242  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  39.11 
 
 
348 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  41.14 
 
 
337 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  39.83 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  37.64 
 
 
356 aa  238  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  45.89 
 
 
330 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  42.81 
 
 
348 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  45.55 
 
 
330 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  39.83 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  38.57 
 
 
370 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  40.34 
 
 
357 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 
352 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  42.91 
 
 
360 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  39.54 
 
 
344 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  39 
 
 
371 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  41.59 
 
 
347 aa  229  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  38.39 
 
 
359 aa  230  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.4 
 
 
372 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
343 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  45.52 
 
 
315 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.12 
 
 
354 aa  226  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.67 
 
 
336 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  41.16 
 
 
344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.18 
 
 
350 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  41.62 
 
 
339 aa  225  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  39.78 
 
 
369 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  41.36 
 
 
355 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  43 
 
 
347 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  42.48 
 
 
363 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  40.57 
 
 
355 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  42.23 
 
 
360 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.73 
 
 
363 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  43.88 
 
 
315 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  38.01 
 
 
331 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  42.64 
 
 
363 aa  222  7e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  44.76 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.76 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  36.59 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  42.52 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  40.88 
 
 
387 aa  219  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  36.04 
 
 
368 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  42.07 
 
 
380 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.24 
 
 
370 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  40.77 
 
 
356 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  39.39 
 
 
356 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  40.79 
 
 
350 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  36.26 
 
 
358 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  41.18 
 
 
338 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
338 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  36.59 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.73 
 
 
338 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  38.97 
 
 
361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.96 
 
 
354 aa  215  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  45.92 
 
 
367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  45.89 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  45.89 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  39.54 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  38.33 
 
 
360 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  41.08 
 
 
359 aa  212  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.44 
 
 
346 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  38.1 
 
 
346 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0534  transport system permease protein  38.67 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40.17 
 
 
336 aa  212  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  37.08 
 
 
357 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  42.81 
 
 
334 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  43.99 
 
 
357 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  42.81 
 
 
334 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36.31 
 
 
343 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  42.81 
 
 
334 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  40.12 
 
 
336 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  38.95 
 
 
345 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  39.52 
 
 
338 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  38.19 
 
 
365 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  39.52 
 
 
338 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>