42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2567 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2567  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 141 aa  279  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  32.35 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  35.51 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  35.14 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  29.46 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  28.81 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  31.86 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  30.91 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  24.24 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  24.24 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  31.11 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  21.05 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  27.72 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  24.43 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  32.18 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  31.46 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  25.44 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  29.6 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  26.83 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  27.06 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  24.74 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  29.09 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  25.56 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  28.3 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  39.47 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  24.8 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  23.48 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0244  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2353  DNA polymerase beta domain protein region  25 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  26.05 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  26.15 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  31.08 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  28.12 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  28.42 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  34.21 
 
 		 102 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>