139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2474 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
201 aa  381  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  48.48 
 
 
197 aa  144  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.8 
 
 
197 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  9.20884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  37.62 
 
 
208 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  37.31 
 
 
211 aa  125  4e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  37.2 
 
 
203 aa  120  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  35 
 
 
204 aa  117  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.65772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  46.23 
 
 
231 aa  117  1e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  36.82 
 
 
211 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  40.2 
 
 
211 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  40.2 
 
 
211 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.32 
 
 
430 aa  111  8e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.69 
 
 
204 aa  110  2e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  34 
 
 
204 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.14 
 
 
198 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  1.05881e-06 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  36.02 
 
 
208 aa  98.2  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.17 
 
 
201 aa  94.7  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  36.45 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  37.98 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  40.35 
 
 
195 aa  87.8  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  33.8 
 
 
214 aa  87.8  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.49 
 
 
198 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  36.07 
 
 
193 aa  82.8  3e-15  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  33.5 
 
 
207 aa  81.3  1e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  33.84 
 
 
194 aa  80.1  2e-14  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.81 
 
 
241 aa  71.2  9e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  35.92 
 
 
204 aa  69.3  4e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  35.41 
 
 
236 aa  65.9  4e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.5 
 
 
218 aa  64.7  8e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.09 
 
 
204 aa  64.3  1e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.62 
 
 
328 aa  63.9  2e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  32.71 
 
 
250 aa  63.9  2e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.77 
 
 
333 aa  62  5e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.31 
 
 
231 aa  62  6e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.65 
 
 
216 aa  62  6e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  29.07 
 
 
226 aa  61.2  9e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.11 
 
 
326 aa  60.5  2e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.37 
 
 
246 aa  59.3  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  28.11 
 
 
245 aa  58.9  4e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  35.56 
 
 
235 aa  59.3  4e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.02 
 
 
213 aa  59.3  4e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  32.87 
 
 
249 aa  58.5  6e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.53 
 
 
241 aa  57.4  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.53 
 
 
241 aa  57.4  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.02 
 
 
352 aa  57.8  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  28.57 
 
 
256 aa  57  2e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  27.36 
 
 
321 aa  56.2  3e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  33.9 
 
 
225 aa  56.2  3e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  33.7 
 
 
246 aa  55.8  4e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.21341e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.91 
 
 
421 aa  55.5  5e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  34.13 
 
 
226 aa  55.5  6e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.93 
 
 
232 aa  55.1  7e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.18 
 
 
261 aa  55.1  7e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.93 
 
 
232 aa  55.1  7e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.93 
 
 
232 aa  55.1  7e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  34.66 
 
 
225 aa  55.1  8e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.52 
 
 
250 aa  54.7  9e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  38.98 
 
 
225 aa  54.3  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  33.16 
 
 
250 aa  53.9  1e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0492  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.94 
 
 
337 aa  54.3  1e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.267913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  34.66 
 
 
225 aa  54.3  1e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  28.24 
 
 
231 aa  54.7  1e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  36.11 
 
 
225 aa  53.9  2e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  28.49 
 
 
214 aa  53.1  2e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  31.25 
 
 
226 aa  53.9  2e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.12 
 
 
343 aa  52.8  3e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.88 
 
 
219 aa  53.1  3e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  35.98 
 
 
226 aa  53.1  3e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  37.4 
 
 
247 aa  52.4  4e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  37.4 
 
 
247 aa  52.4  4e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  26.39 
 
 
230 aa  52.4  4e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  32.59 
 
 
254 aa  52.8  4e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  36.5 
 
 
226 aa  52  5e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.45 
 
 
242 aa  52.4  5e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.94 
 
 
235 aa  51.6  8e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  34.88 
 
 
251 aa  51.2  9e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.48 
 
 
232 aa  50.8  1e-05  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.48 
 
 
354 aa  50.8  1e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.3 
 
 
235 aa  50.1  2e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.81 
 
 
348 aa  50.4  2e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  32.09 
 
 
242 aa  49.7  3e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  33.6 
 
 
239 aa  49.7  3e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  33.67 
 
 
248 aa  49.3  3e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.34 
 
 
342 aa  49.3  4e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  36.44 
 
 
226 aa  49.3  4e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  36.44 
 
 
226 aa  49.3  4e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  25.35 
 
 
213 aa  49.3  4e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0486  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.46 
 
 
337 aa  49.3  4e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  25.69 
 
 
229 aa  48.9  5e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.65 
 
 
232 aa  48.5  6e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.93 
 
 
225 aa  48.5  6e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  35.16 
 
 
229 aa  48.5  6e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  24.53 
 
 
251 aa  48.5  6e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.23 
 
 
232 aa  48.5  7e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.96 
 
 
310 aa  48.5  7e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  34.93 
 
 
339 aa  48.5  7e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.40042e-06  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.07 
 
 
307 aa  48.5  7e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.52 
 
 
306 aa  48.1  8e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  31.88 
 
 
352 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  29.73 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>