More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2438 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 447 aa  925    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 442 aa  210  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 442 aa  210  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  33.11 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 477 aa  202  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  25.67 
 
 		 448 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 449 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.92 
 
 		 434 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 452 aa  146  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 510 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25.67 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.16 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 298 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 339 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 489 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  26.97 
 
 		 329 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 484 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 281 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.22 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 385 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 385 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.99 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  27.04 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.99 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  27.04 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.66 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 463 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.17 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  26.23 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  22 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  19.86 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 366 aa  79.7  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  24.53 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  23.21 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  24.27 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.53 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  22.11 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>