More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2331 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 408 aa  850    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  43.91 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.78 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  44.02 
 
 		 422 aa  299  7e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  42.17 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  42.21 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.1 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  41.73 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.32 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.75 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.48 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  41.18 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  42.17 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  42.71 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  41.37 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  39.95 
 
 		 436 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  40.84 
 
 		 431 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  40.46 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.11 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  42.71 
 
 		 418 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  38.85 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  41.22 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  39.5 
 
 		 431 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  42.16 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  44.57 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  39.9 
 
 		 429 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  39.28 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  41.73 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  38.89 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  40 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  40 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  41.93 
 
 		 378 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 		 410 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  39.38 
 
 		 431 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  40.51 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  40.26 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  39.58 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  40.6 
 
 		 389 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  38.13 
 
 		 425 aa  272  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 355 aa  272  9e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  39.25 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  38.78 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  39.13 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  39.53 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  38.85 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  40 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  37.56 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  38.25 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  38.61 
 
 		 430 aa  269  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  38.82 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  37.63 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  42.66 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  41.51 
 
 		 466 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.4 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  38.69 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  38.3 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.51 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  40.45 
 
 		 413 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  38.3 
 
 		 449 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  40.79 
 
 		 363 aa  262  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  39.12 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  40.8 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  39.94 
 
 		 359 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  37.73 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  38.82 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  37.99 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  42.5 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  42.5 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  38.6 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  42.08 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  38.28 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  37.4 
 
 		 386 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  41.05 
 
 		 359 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  41.88 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  38.32 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  41.03 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  37.34 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  41.95 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  37.63 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  37.85 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.41 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  41.37 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 408 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  40.88 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  36.87 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  38.77 
 
 		 381 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  38.17 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  41.03 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  38.46 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  38.94 
 
 		 385 aa  245  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  37.15 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  42.24 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  40.77 
 
 		 359 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>