140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2318 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 
233 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  32.13 
 
 
234 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  30.77 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  33.7 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  30.14 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  32.22 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  26.64 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  28.49 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  30.17 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  31.11 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  27.85 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  25.11 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.79 
 
 
283 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  25.44 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  31.28 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  27.51 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  27.51 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  32.26 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  32.4 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  31.28 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  31.25 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  31.28 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  31.28 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  27.95 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  30.56 
 
 
322 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  24.36 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  27.07 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  27.57 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  28.98 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.04 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  28.02 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  25.13 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  29.26 
 
 
283 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  25.66 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  26.88 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  27.85 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  31.15 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  26.84 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  27.18 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  30.64 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  30.64 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  25.58 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  25.58 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  25.58 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  25.58 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  25.58 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  25.58 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  26.86 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  25.45 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  30.99 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  28.3 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  27.73 
 
 
342 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  28.33 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  25.39 
 
 
265 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  28.35 
 
 
345 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  26.44 
 
 
306 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  29.61 
 
 
296 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  29.35 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  25.2 
 
 
345 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  29.05 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  35.4 
 
 
292 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 
312 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  27.92 
 
 
338 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  21.66 
 
 
262 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  28.34 
 
 
303 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  25.77 
 
 
267 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  24.55 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  22.58 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  25.23 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  24.23 
 
 
260 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  24.87 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  26.83 
 
 
316 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  26.2 
 
 
303 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  25.38 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  24.61 
 
 
260 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  24.61 
 
 
261 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  28.95 
 
 
263 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  32.03 
 
 
305 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  24.23 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  25.96 
 
 
300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  23.79 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  24.87 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  24.61 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  28.49 
 
 
318 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  28.99 
 
 
342 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  28.74 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  25.84 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  28.74 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  26.09 
 
 
299 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  27.89 
 
 
287 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  29.95 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  26.29 
 
 
308 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  24.05 
 
 
314 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  30.3 
 
 
323 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  28.02 
 
 
309 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  30.3 
 
 
323 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  27.97 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  26.98 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>