More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2311 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  45.62 
 
 		 736 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  46.44 
 
 		 735 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  49.04 
 
 		 719 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  100 
 
 		 726 aa  1481    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  47.77 
 
 		 710 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  45.79 
 
 		 742 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  45.01 
 
 		 738 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  43.29 
 
 		 747 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  44.57 
 
 		 744 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  46.29 
 
 		 722 aa  627  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  43.93 
 
 		 741 aa  625  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  44.41 
 
 		 725 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  44.4 
 
 		 746 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  45.28 
 
 		 750 aa  624  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  44.72 
 
 		 728 aa  618  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  44.95 
 
 		 739 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  43.35 
 
 		 754 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  45.1 
 
 		 732 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  42.18 
 
 		 740 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  42.08 
 
 		 749 aa  606  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  43.44 
 
 		 742 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  44.61 
 
 		 731 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  43.78 
 
 		 746 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  42.61 
 
 		 762 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  42.94 
 
 		 728 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  44.04 
 
 		 727 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  46.1 
 
 		 732 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  42.72 
 
 		 731 aa  596  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  43.63 
 
 		 744 aa  595  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  44.05 
 
 		 731 aa  595  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  43.28 
 
 		 768 aa  591  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  42.9 
 
 		 737 aa  591  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  44.28 
 
 		 733 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  43.06 
 
 		 750 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  42.68 
 
 		 731 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  43.19 
 
 		 740 aa  587  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  46.23 
 
 		 724 aa  588  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  44.34 
 
 		 728 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  43.4 
 
 		 728 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  42.3 
 
 		 733 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  42.28 
 
 		 733 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  42.28 
 
 		 727 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  43.43 
 
 		 728 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  42.11 
 
 		 728 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  42.12 
 
 		 744 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  41.99 
 
 		 744 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  42.45 
 
 		 724 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  44 
 
 		 742 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  44.2 
 
 		 728 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  42.74 
 
 		 738 aa  568  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  44.14 
 
 		 731 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  42.43 
 
 		 738 aa  568  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  43.66 
 
 		 726 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  42.16 
 
 		 728 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  42.68 
 
 		 735 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  40.75 
 
 		 739 aa  561  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  41.29 
 
 		 749 aa  562  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  42.28 
 
 		 736 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  42.32 
 
 		 742 aa  556  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  41.59 
 
 		 736 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  38.19 
 
 		 719 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  40.38 
 
 		 741 aa  512  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.24 
 
 		 744 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  39.92 
 
 		 786 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  38.9 
 
 		 740 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  38.45 
 
 		 719 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  40.14 
 
 		 688 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  38.79 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  38.31 
 
 		 784 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  37.65 
 
 		 715 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  36.07 
 
 		 778 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  36.07 
 
 		 778 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  36.21 
 
 		 778 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.21 
 
 		 778 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.34 
 
 		 778 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  36.07 
 
 		 778 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  36.3 
 
 		 772 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  36.34 
 
 		 778 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  35.94 
 
 		 778 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  36.21 
 
 		 770 aa  446  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  35.68 
 
 		 778 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  36.14 
 
 		 810 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  34.85 
 
 		 825 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  34.85 
 
 		 825 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  36.28 
 
 		 825 aa  412  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  33.42 
 
 		 772 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  35.23 
 
 		 813 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  35.14 
 
 		 834 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  33.38 
 
 		 711 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  34.59 
 
 		 806 aa  388  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  34.57 
 
 		 833 aa  373  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  33.55 
 
 		 792 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  32.76 
 
 		 795 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  34.73 
 
 		 742 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5408  helicase, RecD/TraA family  32.52 
 
 		 741 aa  341  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.68949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  31.52 
 
 		 740 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  31.77 
 
 		 698 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  31.25 
 
 		 698 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  33.56 
 
 		 726 aa  319  9e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  41.15 
 
 		 871 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>