99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2249 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2249  short chain fatty acid transporter  100 
 
 
440 aa  879    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0888  short chain fatty acid transporter  60.64 
 
 
439 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3052  short chain fatty acid transporter  59.69 
 
 
457 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  53.6 
 
 
443 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2938  short chain fatty acid transporter  53.55 
 
 
436 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  54.05 
 
 
442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  54.05 
 
 
442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01176  hypothetical Short chain fatty acid transporter  55.86 
 
 
435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.680659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  53.29 
 
 
436 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  53.83 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3234  short chain fatty acid transporter  53.54 
 
 
451 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3081  short chain fatty acid transporter  53.54 
 
 
451 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.45839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1445  short chain fatty acid transporter  51.5 
 
 
435 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1427  short chain fatty acid transporter  48.64 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2372  putative short chain fatty acid transporter  48.64 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.608941  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2364  putative short chain fatty acid transporter  48.64 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3091  short chain fatty acid transporter  52.75 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1286  short chain fatty acid transporter  52.88 
 
 
451 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.567744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1201  short chain fatty acid transporter  53.79 
 
 
447 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02109  hypothetical protein  48.64 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1435  short chain fatty acid transporter  48.64 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02150  short chain fatty acid transporter  48.64 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.795271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3000  short-chain fatty acids transporter  50.79 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3315  hypothetical protein  50.79 
 
 
448 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3308  hypothetical protein  50.79 
 
 
448 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3097  short-chain fatty acids transporter  51.02 
 
 
448 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3329  hypothetical protein  50.79 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  50.79 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4279  short chain fatty acid transporter  49.77 
 
 
440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0354483  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3328  hypothetical protein  50.34 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3356  hypothetical protein  50.79 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3110  hypothetical protein  50.79 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3747  hypothetical protein  49.09 
 
 
450 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243526  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4221  short chain fatty acid transporter  49.32 
 
 
440 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545369  normal  0.396779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2108  short chain fatty acid transporter  50 
 
 
448 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.289141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  51.24 
 
 
462 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1677  hypothetical protein  49.32 
 
 
440 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121429  normal  0.563194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0831  hypothetical protein  49.66 
 
 
456 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627864  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1708  short chain fatty acid transporter  47.98 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4680  short chain fatty acid transporter  44.09 
 
 
445 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556803  normal  0.668538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3939  short chain fatty acid transporter  43.47 
 
 
445 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.506022  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1419  short chain fatty acid transporter  44.11 
 
 
434 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.989346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3761  short chain fatty acid transporter  42.17 
 
 
442 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0115875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1923  short-chain fatty acids transporter  41.67 
 
 
455 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2419  short chain fatty acid transporter  40.83 
 
 
464 aa  317  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15960  short chain fatty acids transporter  42.86 
 
 
441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.0635103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1689  short chain fatty acid transporter  32.11 
 
 
471 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.316692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2232  short chain fatty acid transporter  31.94 
 
 
474 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.606878  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3457  short-chain fatty acid transporter  29.45 
 
 
472 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2627  short chain fatty acid transporter  33.66 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  0.061315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1381  Short chain fatty acid transporter  31.37 
 
 
482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3147  short chain fatty acid transporter  32.96 
 
 
489 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0648  short chain fatty acid transporter  30.04 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3807  short chain fatty acid transporter  31.25 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164784  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4768  Short chain fatty acid transporter  29.64 
 
 
472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2348  short chain fatty acid transporter  33.66 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.294076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2304  short chain fatty acid transporter  32.67 
 
 
479 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856531  normal  0.0189751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3239  Short chain fatty acid transporter  29.11 
 
 
472 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.243579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4199  short chain fatty acid transporter  30.11 
 
 
492 aa  194  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0850906  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3124  short-chain fatty acid transporter family protein  29.13 
 
 
472 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.04212  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0243  short chain fatty acid transporter  31.18 
 
 
478 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2592  short chain fatty acid transporter  29.13 
 
 
509 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2733  short chain fatty acid transporter  29.13 
 
 
472 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4736  short chain fatty acid transporter  32.29 
 
 
491 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2433  short chain fatty acid transporter  28.44 
 
 
472 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38610  hypothetical protein  30.7 
 
 
474 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.457227  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6880  Short chain fatty acid transporter  31.68 
 
 
483 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0265966  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5759  Short chain fatty acid transporter  30.11 
 
 
482 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0613926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3291  hypothetical protein  30.25 
 
 
474 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33780  Short chain fatty acid transporter family protein  29.56 
 
 
494 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3646  short chain fatty acid transporter  29.13 
 
 
478 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.030585  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.5 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  25.22 
 
 
518 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  26.99 
 
 
516 aa  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  25.43 
 
 
512 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  41.51 
 
 
518 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  34.38 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  34.38 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  34.38 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  34.38 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  34.38 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  34.38 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  34.38 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.449872 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.38 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  43.66 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  34.38 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  34.38 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  23.41 
 
 
484 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  34.38 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  34.38 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  34.38 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  34.38 
 
 
513 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  24.45 
 
 
520 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  31.13 
 
 
481 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  37.33 
 
 
481 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  36.78 
 
 
505 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2000  hypothetical protein  31.13 
 
 
481 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0420164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  28.42 
 
 
511 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.33 
 
 
461 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>