More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2069 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  53.1 
 
 
941 aa  815  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
843 aa  1731  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  37.68 
 
 
765 aa  471  1e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.96 
 
 
905 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.02 
 
 
761 aa  446  1e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  36.02 
 
 
814 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  34.66 
 
 
828 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.79 
 
 
795 aa  406  1e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.6818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.99 
 
 
727 aa  400  1e-110  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  33.37 
 
 
824 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  34.85 
 
 
829 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.71 
 
 
806 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.56 
 
 
727 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.2 
 
 
709 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  33.79 
 
 
880 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  36.26 
 
 
746 aa  361  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  37.05 
 
 
705 aa  360  7e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 
705 aa  359  1e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  36.1 
 
 
705 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  35.83 
 
 
705 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.11 
 
 
668 aa  355  3e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  36.26 
 
 
705 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  36.26 
 
 
705 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  35.52 
 
 
746 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  36.1 
 
 
705 aa  353  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  35.11 
 
 
705 aa  352  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  36.1 
 
 
705 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  36.1 
 
 
705 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  32.15 
 
 
861 aa  339  2e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.95 
 
 
648 aa  338  3e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 
646 aa  329  1e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  34.7 
 
 
901 aa  329  2e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  33.94 
 
 
706 aa  326  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 
661 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.35 
 
 
734 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  34.63 
 
 
618 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  37.86 
 
 
732 aa  317  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.59 
 
 
739 aa  317  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  35.81 
 
 
735 aa  314  5e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  34.28 
 
 
667 aa  313  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.44476e-08 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  34.28 
 
 
680 aa  311  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.01 
 
 
685 aa  311  5e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  35.66 
 
 
720 aa  310  7e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
679 aa  310  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  34.4 
 
 
916 aa  309  1e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  34.11 
 
 
680 aa  309  1e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  6.91863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  34.05 
 
 
680 aa  308  2e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.66869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  34.11 
 
 
673 aa  309  2e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  36.47 
 
 
776 aa  309  2e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  34.11 
 
 
673 aa  309  2e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.33103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  34.22 
 
 
680 aa  309  2e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.07 
 
 
643 aa  309  2e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.17 
 
 
654 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  32.23 
 
 
912 aa  308  4e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.43 
 
 
714 aa  307  5e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.91 
 
 
643 aa  307  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.91 
 
 
643 aa  307  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.13 
 
 
649 aa  306  1e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 
727 aa  305  2e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  35.71 
 
 
714 aa  305  2e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 
766 aa  305  2e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  35.6 
 
 
728 aa  305  3e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  32.76 
 
 
680 aa  304  4e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.61 
 
 
680 aa  304  4e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  1.38665e-10 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.92 
 
 
640 aa  304  5e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  33.02 
 
 
640 aa  304  5e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.34 
 
 
625 aa  304  5e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 
727 aa  303  8e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  38.15 
 
 
734 aa  303  8e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  37.04 
 
 
770 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  32.69 
 
 
693 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.43648e-11  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  33.18 
 
 
679 aa  302  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  33.33 
 
 
918 aa  302  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  37.17 
 
 
811 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  33.59 
 
 
834 aa  300  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  33.59 
 
 
835 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.28 
 
 
648 aa  300  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.17 
 
 
833 aa  299  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  30.43 
 
 
830 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  33.99 
 
 
839 aa  298  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  36.7 
 
 
763 aa  297  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  33.59 
 
 
820 aa  297  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  33.59 
 
 
846 aa  296  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.7 
 
 
730 aa  296  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.3 
 
 
761 aa  296  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  33.59 
 
 
834 aa  296  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  33.6 
 
 
721 aa  296  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  34.42 
 
 
676 aa  296  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  34.08 
 
 
837 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.35 
 
 
679 aa  295  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.03 
 
 
728 aa  294  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  30.63 
 
 
820 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  37.48 
 
 
757 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  34.64 
 
 
656 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.95 
 
 
776 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  35.25 
 
 
724 aa  292  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
708 aa  291  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  35.07 
 
 
718 aa  290  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  31.87 
 
 
662 aa  290  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  35.08 
 
 
714 aa  290  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>