45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2045 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2045  SurA domain  100 
 
 
232 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000747352  decreased coverage  0.0000000000259869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1613  SurA domain  38.78 
 
 
255 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000247502  unclonable  3.15321e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0595  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.35 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.880292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1985  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.49 
 
 
322 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0014  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.11 
 
 
418 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0112  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000942479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2037  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  25.29 
 
 
329 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147855  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22470  SurA-like protein  29.7 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.44 
 
 
436 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1079  hypothetical protein  26.4 
 
 
460 aa  49.3  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.616698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0719  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.79 
 
 
350 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.87 
 
 
355 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28000  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  27.89 
 
 
438 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0157  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.56 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194598  hitchhiker  0.00636853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  26.19 
 
 
430 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2806  peptidylprolyl isomerase  25.13 
 
 
342 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.15 
 
 
495 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000838067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.51 
 
 
452 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.7 
 
 
453 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1831  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32 
 
 
263 aa  45.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  29.51 
 
 
452 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.51 
 
 
452 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  30.89 
 
 
451 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2492  peptidylprolyl isomerase  21.88 
 
 
342 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.27 
 
 
327 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.750083  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
301 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  33.33 
 
 
463 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0015  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  27.12 
 
 
321 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.97 
 
 
437 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3168  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.18 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00695728  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00397  hypothetical protein  24.18 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2132  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.79 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363889  normal  0.365431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0527  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  24.18 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00679494  normal  0.63338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0364  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  24.18 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0524486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0484  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  24.18 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00718349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  24.18 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102497  normal  0.0107866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00393  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  24.18 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0477  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase D)  24.18 
 
 
623 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00264231  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  30.33 
 
 
465 aa  42.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1280  peptidylprolyl isomerase  24.68 
 
 
285 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.43 
 
 
316 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1320  peptidylprolyl isomerase  24.68 
 
 
285 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  30.08 
 
 
452 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.08 
 
 
452 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.08 
 
 
452 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>