More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2002 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  100 
 
 
409 aa  837    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.85 
 
 
438 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.98 
 
 
438 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  36.61 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.56 
 
 
445 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.73 
 
 
440 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.47 
 
 
440 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.27 
 
 
434 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.16 
 
 
389 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.58 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  32.8 
 
 
383 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.01 
 
 
429 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.71 
 
 
428 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  33.93 
 
 
401 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.39 
 
 
392 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  31 
 
 
418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  33.44 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  29.2 
 
 
419 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.16 
 
 
394 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  32.7 
 
 
418 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  32.05 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.16 
 
 
420 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.16 
 
 
420 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.16 
 
 
420 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.16 
 
 
420 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.84 
 
 
420 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.84 
 
 
420 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.52 
 
 
420 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.16 
 
 
420 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.16 
 
 
420 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  33.54 
 
 
346 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  29.97 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.21 
 
 
420 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  30.16 
 
 
415 aa  159  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
538 aa  159  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 
554 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.91 
 
 
413 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
418 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 
418 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 
418 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.38 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
410 aa  154  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  27.78 
 
 
370 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
484 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.74 
 
 
401 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4942  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.38 
 
 
395 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0902  histidyl-tRNA synthetase 2  28.22 
 
 
395 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.188473  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
418 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1281  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.56 
 
 
393 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.679748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.11 
 
 
395 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.11 
 
 
395 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
421 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  27.06 
 
 
466 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4938  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  28.03 
 
 
395 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.65 
 
 
394 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0576  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.76 
 
 
395 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.12 
 
 
394 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0527  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.95 
 
 
395 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558326  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.5 
 
 
392 aa  143  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 
421 aa  142  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07590  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.95 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
409 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
470 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
426 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0640  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.05 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226727 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
419 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0747  Histidine--tRNA ligase  29.73 
 
 
386 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000807665  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 
410 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 
431 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
410 aa  137  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
349 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  28.57 
 
 
349 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  28.57 
 
 
349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  24.93 
 
 
393 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2505  histidine--tRNA ligase  27.39 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000404758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2662  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  26.17 
 
 
394 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2834  histidyl-tRNA synthetase 2  27.19 
 
 
368 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
421 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  25.33 
 
 
525 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2765  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  25.47 
 
 
393 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2627  tRNA synthetase class II (G H P and S)  26.65 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000799306 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.83 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1093  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.46 
 
 
389 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29417  predicted protein  25.52 
 
 
405 aa  126  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.024328  hitchhiker  0.00343587 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2586  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.92 
 
 
397 aa  126  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.368474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.84 
 
 
401 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
423 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2008  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.04 
 
 
399 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00513827  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 
436 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.75 
 
 
383 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2173  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.3 
 
 
375 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>