25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1929 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1929  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1638  putative cobalamin biosyntheis protein M  28.08 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.9 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.9 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.27 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  28.79 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.3 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.65 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  0.00000105881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.34 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.3 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  29.91 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  26.14 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.52 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.39 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.56 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  27.61 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  26.87 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  29.37 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  29.37 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  34.75 
 
 		 193 aa  42.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.33 
 
 		 232 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.33 
 
 		 232 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.33 
 
 		 232 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  30.09 
 
 		 195 aa  42  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.63 
 
 		 198 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.540876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>