19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1893 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1893  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  30.89 
 
 		 363 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03980  putative transmembrane anti-sigma factor  29.5 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000793446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  39.39 
 
 		 465 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  35.29 
 
 		 329 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  26.56 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  36.23 
 
 		 360 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4526  hypothetical protein  31.15 
 
 		 311 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  30.95 
 
 		 384 aa  45.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0273  putative transmembrane anti-sigma factor  35.94 
 
 		 135 aa  45.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287292  normal  0.724459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  30.16 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0231  Fe-S oxidoreductase  36.67 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  28.32 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2732  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0296  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.69 
 
 		 512 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166156  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0242  Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 		 465 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.479681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  30.21 
 
 		 371 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  33.87 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>