More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1828 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.79 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  29.91 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 188 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5107  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0633461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  26.82 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.41 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.1 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  25.23 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  25.7 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  25.37 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  25.15 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  25.44 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.47 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.47 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.22 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  24.64 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  24.64 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  24.64 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  23.47 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  24.39 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27.23 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  29.73 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  24.15 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  25.3 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  29.22 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  24.77 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  27.56 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  23.95 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  26.4 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  23.7 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  25.24 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  25.15 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.32 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  23.67 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.92 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  24.76 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  22.73 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  26.92 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  25.48 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  24 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  25.64 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  25.86 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  25.42 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  24.69 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  24 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  24 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  24 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>