More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1807 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  100 
 
 
451 aa  936    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  38.8 
 
 
436 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.23 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  38.07 
 
 
454 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.92 
 
 
449 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  37.74 
 
 
434 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  36.22 
 
 
434 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  36.08 
 
 
431 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  35.67 
 
 
451 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.32 
 
 
450 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  35.44 
 
 
450 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  35.44 
 
 
450 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  35.44 
 
 
450 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  35.44 
 
 
450 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  35.44 
 
 
450 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  35.44 
 
 
450 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  35.44 
 
 
450 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  33.64 
 
 
435 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  35.63 
 
 
446 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  35.44 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  35.44 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  35.19 
 
 
450 aa  266  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  35.02 
 
 
448 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  35.02 
 
 
448 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  35.19 
 
 
450 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  35.77 
 
 
448 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  36.74 
 
 
449 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.66 
 
 
429 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.9 
 
 
450 aa  249  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.86 
 
 
416 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.1 
 
 
456 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.81 
 
 
429 aa  246  4e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.74 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  33.9 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  36.24 
 
 
437 aa  244  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.01 
 
 
471 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.56 
 
 
429 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.94 
 
 
444 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.38 
 
 
439 aa  239  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  33.41 
 
 
416 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.64 
 
 
442 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.05 
 
 
466 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.83 
 
 
449 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  35.27 
 
 
438 aa  236  7e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.15 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  34.47 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.95 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  32.59 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.74 
 
 
421 aa  234  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.52 
 
 
417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  33.41 
 
 
413 aa  233  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.57 
 
 
444 aa  233  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.13 
 
 
431 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.75 
 
 
435 aa  232  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.18 
 
 
434 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.87 
 
 
409 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.07 
 
 
438 aa  231  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  33.58 
 
 
441 aa  230  5e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.64 
 
 
451 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.44 
 
 
495 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  31.72 
 
 
436 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.6 
 
 
438 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.63 
 
 
434 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.14 
 
 
425 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.07 
 
 
442 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.4 
 
 
434 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  35 
 
 
427 aa  224  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.28 
 
 
411 aa  224  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  35 
 
 
427 aa  224  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  30.89 
 
 
440 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1645  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.13 
 
 
410 aa  222  8e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447021  hitchhiker  0.00298865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  32 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.71 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.5 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.95 
 
 
442 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000060077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.79 
 
 
451 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15041  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.82 
 
 
464 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.82 
 
 
441 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14661  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.23 
 
 
464 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.222068  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1401  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.73 
 
 
463 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1484  RNA modification enzyme, MiaB family  32.43 
 
 
497 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.97 
 
 
471 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.76 
 
 
451 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14911  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.62 
 
 
464 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.41 
 
 
437 aa  217  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3288  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.72 
 
 
451 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2835  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.72 
 
 
446 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  31.74 
 
 
440 aa  216  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.57 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.47 
 
 
494 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.81 
 
 
452 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.85 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.08 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0377  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.25 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115898  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  30.82 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  31.78 
 
 
450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3249  RNA modification enzyme, MiaB family  30.79 
 
 
443 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.03 
 
 
463 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17251  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.03 
 
 
463 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>