More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1796 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  100 
 
 
341 aa  688    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.86 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.42 
 
 
337 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.86 
 
 
338 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.96 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.75 
 
 
338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.81 
 
 
337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.77 
 
 
338 aa  447  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.06 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.47 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.86 
 
 
336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.27 
 
 
348 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.69 
 
 
344 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.85 
 
 
363 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.83 
 
 
330 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.55 
 
 
357 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.72 
 
 
349 aa  434  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.31 
 
 
349 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
333 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
336 aa  434  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
333 aa  434  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
333 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.46 
 
 
335 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.69 
 
 
541 aa  434  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.55 
 
 
357 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.24 
 
 
334 aa  431  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.11 
 
 
345 aa  431  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.24 
 
 
357 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
333 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.63 
 
 
354 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
333 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
333 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 
333 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.63 
 
 
355 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.69 
 
 
333 aa  431  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  63.72 
 
 
349 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.19 
 
 
353 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
345 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.07 
 
 
333 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 
337 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.92 
 
 
352 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.86 
 
 
341 aa  425  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.45 
 
 
347 aa  424  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.45 
 
 
336 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
334 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.03 
 
 
334 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 
334 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.03 
 
 
334 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.03 
 
 
334 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 
339 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.38 
 
 
351 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.85 
 
 
355 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
336 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.53 
 
 
358 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 
335 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.38 
 
 
338 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.92 
 
 
354 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.03 
 
 
347 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 
350 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.16 
 
 
347 aa  421  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
335 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.77 
 
 
346 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.77 
 
 
346 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.24 
 
 
351 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.8 
 
 
344 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.42 
 
 
334 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  64.1 
 
 
355 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.06 
 
 
352 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 
361 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 
336 aa  417  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 
336 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 
353 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
334 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.6 
 
 
350 aa  418  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.93 
 
 
340 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.74 
 
 
343 aa  418  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.54 
 
 
363 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.05 
 
 
354 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.35 
 
 
337 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.37 
 
 
355 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.21 
 
 
334 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 
334 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
336 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
336 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.29 
 
 
352 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.21 
 
 
334 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 
345 aa  418  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 
334 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.28 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.77 
 
 
354 aa  414  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.28 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.31 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.21 
 
 
334 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.54 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.28 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.21 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>