More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1786 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  100 
 
 
489 aa  1013    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  43.26 
 
 
447 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  45.36 
 
 
450 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  39.96 
 
 
450 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  38.41 
 
 
473 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  42.72 
 
 
461 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 
453 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  40.26 
 
 
458 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  42.96 
 
 
452 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  40.16 
 
 
489 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  44.31 
 
 
460 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 
456 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  36.4 
 
 
476 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  42 
 
 
452 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 
457 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 
450 aa  326  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  31.27 
 
 
492 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.81 
 
 
484 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 
462 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.35 
 
 
463 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  27.66 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
460 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  28.12 
 
 
470 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 
453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 
485 aa  163  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 
447 aa  162  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
439 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 
476 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 
476 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  27.75 
 
 
476 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 
476 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 
476 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 
403 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 
486 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 
468 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.88 
 
 
457 aa  110  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 
728 aa  106  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 
443 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 
351 aa  106  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 
518 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  21.66 
 
 
462 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 
434 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 
447 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  28.76 
 
 
432 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 
434 aa  97.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 
471 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 
467 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 
402 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 
394 aa  95.1  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.44 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.44 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
365 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  21.84 
 
 
499 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 
460 aa  94  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.04 
 
 
438 aa  93.6  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 
459 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.08 
 
 
446 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 
400 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 
387 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
385 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.78 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 
374 aa  91.3  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.62 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.78 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 
446 aa  90.1  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  26.22 
 
 
481 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 
429 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 
474 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 
455 aa  87.4  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 
369 aa  86.7  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 
481 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.51 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.8 
 
 
431 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.51 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 
800 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 
405 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.22 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  28.46 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>