More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1770 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  100 
 
 
114 aa  229  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  75.73 
 
 
226 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
265 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
237 aa  164  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
237 aa  164  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
237 aa  164  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
237 aa  164  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
237 aa  164  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
237 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
237 aa  164  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  66.07 
 
 
237 aa  164  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  66.07 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  65.18 
 
 
237 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  64.6 
 
 
236 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  64.66 
 
 
256 aa  156  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  63.72 
 
 
245 aa  155  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  64.35 
 
 
234 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  65.69 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  65.09 
 
 
244 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  66.35 
 
 
236 aa  144  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  61.82 
 
 
231 aa  142  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  63.55 
 
 
126 aa  142  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  67.35 
 
 
232 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  56.64 
 
 
239 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  53.23 
 
 
249 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  62.64 
 
 
241 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  57.84 
 
 
233 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  57.84 
 
 
233 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  60.42 
 
 
239 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  60.42 
 
 
239 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  60.44 
 
 
243 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  47.37 
 
 
232 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
239 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  59.38 
 
 
243 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  59.09 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  58.33 
 
 
241 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  57.29 
 
 
249 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  57.95 
 
 
242 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  55.21 
 
 
235 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  55.21 
 
 
235 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  57.14 
 
 
241 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  58.33 
 
 
241 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  56.04 
 
 
245 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  51.28 
 
 
244 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  56.52 
 
 
219 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  50.98 
 
 
240 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  61.54 
 
 
249 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  50.52 
 
 
244 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  54.64 
 
 
246 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  43.33 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  48.75 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  43.48 
 
 
260 aa  80.1  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  43.53 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  46.74 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  47.5 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  43.75 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  43.75 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2414  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.5 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000700134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0650  RpoD family RNA polymerase sigma factor  42.22 
 
 
418 aa  72  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.5 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  44.16 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  39.33 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03010  hypothetical protein  45 
 
 
287 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1314  RNA polymerase sigma factor RpoD  45 
 
 
357 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000145678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1315  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  46.25 
 
 
413 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  42.5 
 
 
259 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  44.05 
 
 
261 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1977  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  45 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.129295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  35.8 
 
 
250 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1231  RNA polymerase, sigma 28 subunit  41.49 
 
 
294 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  41.11 
 
 
272 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  45 
 
 
369 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  40 
 
 
257 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0937  RNA polymerase sigma-70 factor family protein  40.4 
 
 
286 aa  70.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  42.5 
 
 
407 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000691641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  42.5 
 
 
407 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000061259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  41.25 
 
 
259 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  42.5 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4683  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  42.5 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3521  RpoD family RNA polymerase sigma factor  45 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0582772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1430  DNA-directed RNA polymerase, sigma 70/sigma 32 subunit  46.25 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000837712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1029  RpoD family RNA polymerase sigma factor  40 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1661  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  47.14 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.691015  normal  0.251698 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4042  RNA polymerase sigma factor RpoD  45 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000102439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4515  RNA polymerase sigma factor RpoD  45 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000315443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  45 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1215  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  45 
 
 
360 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000256701  hitchhiker  0.00656648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4314  RNA polymerase sigma factor RpoD  45 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.2227e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3019  RNA polymerase sigma factor RpoD  45 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000207905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>