125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1745 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  100 
 
 
303 aa  628  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  51.32 
 
 
306 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  48.5 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  48.17 
 
 
312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  50.88 
 
 
298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  47.81 
 
 
336 aa  295  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  48.47 
 
 
301 aa  293  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  45.79 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  44.15 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  47.73 
 
 
300 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  43.84 
 
 
300 aa  278  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  46.2 
 
 
334 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  45.21 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  45.87 
 
 
334 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  46.24 
 
 
305 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  43.3 
 
 
308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  46.32 
 
 
307 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 
319 aa  268  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 
309 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  44.03 
 
 
318 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  45.86 
 
 
302 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  45.32 
 
 
323 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  46.75 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  46.21 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  43.63 
 
 
296 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  41.13 
 
 
373 aa  233  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  42.16 
 
 
298 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  41.07 
 
 
286 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  41.07 
 
 
286 aa  228  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  46.25 
 
 
303 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  46.25 
 
 
303 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  41.7 
 
 
296 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 
283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  43.58 
 
 
326 aa  215  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 
319 aa  215  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  44.31 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 
320 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 
320 aa  212  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 
287 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  42.08 
 
 
313 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 
295 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
331 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 
344 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  34.57 
 
 
321 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  34.84 
 
 
293 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  37.4 
 
 
355 aa  170  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  38.15 
 
 
373 aa  168  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 
372 aa  162  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  35.09 
 
 
374 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  35.74 
 
 
371 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.51 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  32.79 
 
 
345 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  27.11 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 
332 aa  60.1  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 
388 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 
364 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 
365 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 
356 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  26.37 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
337 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 
356 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 
337 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 
351 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.24 
 
 
353 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 
372 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  22.18 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  22.45 
 
 
358 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 
367 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  23.57 
 
 
358 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 
337 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  23.47 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  24.38 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 
365 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
357 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 
376 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 
384 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 
363 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 
405 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  21.67 
 
 
287 aa  46.2  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 
297 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  21.99 
 
 
336 aa  45.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>