More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1721 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  100 
 
 
189 aa  391  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  40.99 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  38.89 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  38.12 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  33.91 
 
 
229 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  38.41 
 
 
166 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  36.97 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  35.88 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  37.5 
 
 
171 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  31.11 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  31.11 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  35.93 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  37.95 
 
 
181 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  30 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  36.42 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  34.15 
 
 
195 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2486  shikimate kinase  33.15 
 
 
190 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0460027  normal  0.0259491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  34.73 
 
 
170 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  35.58 
 
 
172 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  31.18 
 
 
185 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  30.68 
 
 
206 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  35.8 
 
 
458 aa  104  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  35.62 
 
 
173 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  35.36 
 
 
190 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  33.74 
 
 
182 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  33.95 
 
 
175 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  32.5 
 
 
168 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  37.28 
 
 
176 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  32.14 
 
 
190 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  34.51 
 
 
175 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  35.4 
 
 
167 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  35.12 
 
 
181 aa  101  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  34.55 
 
 
173 aa  101  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  31.98 
 
 
192 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  32.26 
 
 
183 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3110  shikimate kinase  37.13 
 
 
174 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  35.54 
 
 
182 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  33.13 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  35.09 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  36.75 
 
 
187 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  30.81 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  37.35 
 
 
187 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1731  shikimate kinase  36.17 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  34.81 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  29.71 
 
 
199 aa  98.2  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3248  shikimate kinase  32.32 
 
 
179 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  36.09 
 
 
176 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  33.55 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  32 
 
 
219 aa  97.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2901  shikimate kinase  33.33 
 
 
179 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  29.71 
 
 
209 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  36.97 
 
 
169 aa  97.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  35.15 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  29.71 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  29.07 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  31.71 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  29.71 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  29.71 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  34.12 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  29.71 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  29.71 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  29.71 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  31.95 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  34.52 
 
 
175 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  34.52 
 
 
175 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.21 
 
 
593 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  32.54 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  30.49 
 
 
200 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  31.18 
 
 
177 aa  94.4  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  37.72 
 
 
277 aa  94.4  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  37.41 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  34.73 
 
 
172 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  36.2 
 
 
165 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  32.41 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  31.61 
 
 
184 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  36.2 
 
 
165 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  32.19 
 
 
183 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  32.88 
 
 
178 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  33.75 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  35.58 
 
 
165 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  32.32 
 
 
199 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  31.93 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  36.53 
 
 
454 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  31.36 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  36.6 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  35.17 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  29.76 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  31.03 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  35.58 
 
 
170 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0535  shikimate kinase  30.49 
 
 
205 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.74412  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  31.76 
 
 
189 aa  92  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  33.75 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  34.36 
 
 
165 aa  92  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  32.92 
 
 
190 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  30.46 
 
 
176 aa  92  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  33.93 
 
 
462 aa  91.7  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  30.95 
 
 
182 aa  91.3  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  33.94 
 
 
166 aa  90.9  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1534  Shikimate kinase  33.73 
 
 
170 aa  90.9  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  32.87 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>