More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1668 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.78 
 
 		 296 aa  361  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.52 
 
 		 298 aa  361  8e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  55.93 
 
 		 295 aa  361  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.78 
 
 		 296 aa  361  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.78 
 
 		 296 aa  360  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.45 
 
 		 296 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.45 
 
 		 296 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.77 
 
 		 296 aa  359  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  359  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  57.43 
 
 		 296 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.11 
 
 		 296 aa  358  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  57.05 
 
 		 299 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  56.08 
 
 		 296 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  53.9 
 
 		 294 aa  339  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  53.22 
 
 		 296 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  51.86 
 
 		 295 aa  331  9e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  52.03 
 
 		 296 aa  325  6e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  51.19 
 
 		 295 aa  315  7e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  48.14 
 
 		 294 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  48.17 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  49.83 
 
 		 295 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  47.51 
 
 		 302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  49.15 
 
 		 295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  49.15 
 
 		 295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  47.84 
 
 		 302 aa  305  6e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  47.12 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  46.76 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  49.48 
 
 		 291 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  47.3 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  48.48 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  46.44 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  46.44 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  46.44 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 292 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  49.13 
 
 		 290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  49.3 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  47.46 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  46.1 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  46.44 
 
 		 295 aa  278  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  45.42 
 
 		 307 aa  278  9e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  45.42 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  44.97 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  46.31 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  45.08 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  45.95 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  45.76 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  43.73 
 
 		 298 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  44.48 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 		 299 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  44.75 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  42.67 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  44.76 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  41.53 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  43.73 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  45.07 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  43 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  45.33 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  41.95 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  43.52 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  44.41 
 
 		 295 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  40.67 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  44.33 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.33 
 
 		 298 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  43.3 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  45.14 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  43.9 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  45.14 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  45.14 
 
 		 309 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  43.75 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  39.68 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  44.79 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  43.3 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  44.79 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  38.89 
 
 		 346 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  41.44 
 
 		 315 aa  257  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.91 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  44.56 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  38.69 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  43.3 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  41.36 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  42.96 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  42.61 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  42.14 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  43 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  46.78 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  44.25 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  43.86 
 
 		 312 aa  255  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  41.86 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  44.07 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  43.6 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.92 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  44.79 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  39.74 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  41.41 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>